Protein–RNA interactions for Protein: Q15139

PRKD1, Serine/threonine-protein kinase D1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD1Q15139 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRKD1Q15139 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRKD1Q15139 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRKD1Q15139 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRKD1Q15139 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRKD1Q15139 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRKD1Q15139 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRKD1Q15139 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRKD1Q15139 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRKD1Q15139 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRKD1Q15139 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRKD1Q15139 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRKD1Q15139 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRKD1Q15139 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRKD1Q15139 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PRKD1Q15139 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRKD1Q15139 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRKD1Q15139 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRKD1Q15139 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRKD1Q15139 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRKD1Q15139 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRKD1Q15139 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRKD1Q15139 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PRKD1Q15139 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRKD1Q15139 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRKD1Q15139 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRKD1Q15139 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PRKD1Q15139 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRKD1Q15139 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRKD1Q15139 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRKD1Q15139 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRKD1Q15139 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRKD1Q15139 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRKD1Q15139 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRKD1Q15139 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRKD1Q15139 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRKD1Q15139 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRKD1Q15139 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRKD1Q15139 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRKD1Q15139 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRKD1Q15139 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRKD1Q15139 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRKD1Q15139 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRKD1Q15139 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRKD1Q15139 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PRKD1Q15139 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PRKD1Q15139 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
PRKD1Q15139 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRKD1Q15139 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRKD1Q15139 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRKD1Q15139 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRKD1Q15139 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRKD1Q15139 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRKD1Q15139 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRKD1Q15139 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRKD1Q15139 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRKD1Q15139 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRKD1Q15139 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRKD1Q15139 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRKD1Q15139 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRKD1Q15139 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRKD1Q15139 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRKD1Q15139 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRKD1Q15139 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRKD1Q15139 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRKD1Q15139 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRKD1Q15139 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRKD1Q15139 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRKD1Q15139 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRKD1Q15139 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRKD1Q15139 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRKD1Q15139 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRKD1Q15139 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRKD1Q15139 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRKD1Q15139 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRKD1Q15139 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRKD1Q15139 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRKD1Q15139 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRKD1Q15139 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRKD1Q15139 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRKD1Q15139 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRKD1Q15139 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRKD1Q15139 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRKD1Q15139 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRKD1Q15139 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRKD1Q15139 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRKD1Q15139 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRKD1Q15139 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRKD1Q15139 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRKD1Q15139 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRKD1Q15139 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PRKD1Q15139 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRKD1Q15139 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRKD1Q15139 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRKD1Q15139 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRKD1Q15139 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRKD1Q15139 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRKD1Q15139 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRKD1Q15139 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRKD1Q15139 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
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