Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RAB3GAP1Q15042 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RAB3GAP1Q15042 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RAB3GAP1Q15042 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
RAB3GAP1Q15042 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RAB3GAP1Q15042 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
RAB3GAP1Q15042 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
RAB3GAP1Q15042 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RAB3GAP1Q15042 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RAB3GAP1Q15042 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RAB3GAP1Q15042 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RAB3GAP1Q15042 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
RAB3GAP1Q15042 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
RAB3GAP1Q15042 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RAB3GAP1Q15042 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RAB3GAP1Q15042 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RAB3GAP1Q15042 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RAB3GAP1Q15042 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RAB3GAP1Q15042 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RAB3GAP1Q15042 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RAB3GAP1Q15042 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RAB3GAP1Q15042 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RAB3GAP1Q15042 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RAB3GAP1Q15042 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
RAB3GAP1Q15042 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RAB3GAP1Q15042 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RAB3GAP1Q15042 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RAB3GAP1Q15042 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RAB3GAP1Q15042 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RAB3GAP1Q15042 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RAB3GAP1Q15042 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RAB3GAP1Q15042 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RAB3GAP1Q15042 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RAB3GAP1Q15042 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RAB3GAP1Q15042 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RAB3GAP1Q15042 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RAB3GAP1Q15042 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RAB3GAP1Q15042 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RAB3GAP1Q15042 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RAB3GAP1Q15042 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RAB3GAP1Q15042 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RAB3GAP1Q15042 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RAB3GAP1Q15042 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RAB3GAP1Q15042 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RAB3GAP1Q15042 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RAB3GAP1Q15042 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RAB3GAP1Q15042 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RAB3GAP1Q15042 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RAB3GAP1Q15042 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RAB3GAP1Q15042 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RAB3GAP1Q15042 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RAB3GAP1Q15042 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RAB3GAP1Q15042 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RAB3GAP1Q15042 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RAB3GAP1Q15042 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RAB3GAP1Q15042 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RAB3GAP1Q15042 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RAB3GAP1Q15042 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
RAB3GAP1Q15042 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RAB3GAP1Q15042 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RAB3GAP1Q15042 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
RAB3GAP1Q15042 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RAB3GAP1Q15042 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RAB3GAP1Q15042 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RAB3GAP1Q15042 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
RAB3GAP1Q15042 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RAB3GAP1Q15042 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RAB3GAP1Q15042 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RAB3GAP1Q15042 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RAB3GAP1Q15042 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RAB3GAP1Q15042 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RAB3GAP1Q15042 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RAB3GAP1Q15042 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RAB3GAP1Q15042 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RAB3GAP1Q15042 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RAB3GAP1Q15042 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RAB3GAP1Q15042 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RAB3GAP1Q15042 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RAB3GAP1Q15042 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RAB3GAP1Q15042 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RAB3GAP1Q15042 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RAB3GAP1Q15042 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RAB3GAP1Q15042 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RAB3GAP1Q15042 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RAB3GAP1Q15042 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RAB3GAP1Q15042 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RAB3GAP1Q15042 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RAB3GAP1Q15042 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RAB3GAP1Q15042 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RAB3GAP1Q15042 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
RAB3GAP1Q15042 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RAB3GAP1Q15042 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RAB3GAP1Q15042 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RAB3GAP1Q15042 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RAB3GAP1Q15042 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RAB3GAP1Q15042 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RAB3GAP1Q15042 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RAB3GAP1Q15042 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RAB3GAP1Q15042 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RAB3GAP1Q15042 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
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