Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
GAPVD1Q14C86 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC37.59■■■■□ 3.61
GAPVD1Q14C86 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC37.59■■■■□ 3.61
GAPVD1Q14C86 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.59■■■■□ 3.61
GAPVD1Q14C86 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
GAPVD1Q14C86 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
GAPVD1Q14C86 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC37.59■■■■□ 3.61
GAPVD1Q14C86 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC37.59■■■■□ 3.61
GAPVD1Q14C86 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC37.59■■■■□ 3.61
GAPVD1Q14C86 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC37.58■■■■□ 3.61
GAPVD1Q14C86 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC37.58■■■■□ 3.61
GAPVD1Q14C86 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
GAPVD1Q14C86 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
GAPVD1Q14C86 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC37.58■■■■□ 3.61
GAPVD1Q14C86 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
GAPVD1Q14C86 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC37.58■■■■□ 3.61
GAPVD1Q14C86 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC37.58■■■■□ 3.61
GAPVD1Q14C86 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
GAPVD1Q14C86 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC37.57■■■■□ 3.61
GAPVD1Q14C86 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.61
GAPVD1Q14C86 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.57■■■■□ 3.6
GAPVD1Q14C86 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
GAPVD1Q14C86 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC37.57■■■■□ 3.6
GAPVD1Q14C86 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC37.57■■■■□ 3.6
GAPVD1Q14C86 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC37.57■■■■□ 3.6
GAPVD1Q14C86 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
GAPVD1Q14C86 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
GAPVD1Q14C86 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
GAPVD1Q14C86 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
GAPVD1Q14C86 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC37.56■■■■□ 3.6
GAPVD1Q14C86 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC37.56■■■■□ 3.6
GAPVD1Q14C86 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
GAPVD1Q14C86 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC37.55■■■■□ 3.6
GAPVD1Q14C86 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
GAPVD1Q14C86 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
GAPVD1Q14C86 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.55■■■■□ 3.6
GAPVD1Q14C86 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC37.55■■■■□ 3.6
GAPVD1Q14C86 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
GAPVD1Q14C86 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC37.55■■■■□ 3.6
GAPVD1Q14C86 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC37.55■■■■□ 3.6
GAPVD1Q14C86 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
GAPVD1Q14C86 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
GAPVD1Q14C86 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.55■■■■□ 3.6
GAPVD1Q14C86 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
GAPVD1Q14C86 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC37.54■■■■□ 3.6
GAPVD1Q14C86 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.54■■■■□ 3.6
GAPVD1Q14C86 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.54■■■■□ 3.6
GAPVD1Q14C86 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.54■■■■□ 3.6
GAPVD1Q14C86 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC37.54■■■■□ 3.6
GAPVD1Q14C86 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
GAPVD1Q14C86 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC37.53■■■■□ 3.6
GAPVD1Q14C86 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
GAPVD1Q14C86 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC37.53■■■■□ 3.6
GAPVD1Q14C86 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
GAPVD1Q14C86 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC37.53■■■■□ 3.6
GAPVD1Q14C86 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC37.52■■■■□ 3.6
GAPVD1Q14C86 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC37.52■■■■□ 3.6
GAPVD1Q14C86 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC37.52■■■■□ 3.6
GAPVD1Q14C86 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC37.52■■■■□ 3.6
GAPVD1Q14C86 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
GAPVD1Q14C86 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
GAPVD1Q14C86 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
GAPVD1Q14C86 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.51■■■■□ 3.6
GAPVD1Q14C86 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
GAPVD1Q14C86 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC37.51■■■■□ 3.59
GAPVD1Q14C86 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
GAPVD1Q14C86 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.51■■■■□ 3.59
GAPVD1Q14C86 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
GAPVD1Q14C86 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC37.51■■■■□ 3.59
GAPVD1Q14C86 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC37.51■■■■□ 3.59
GAPVD1Q14C86 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
GAPVD1Q14C86 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC37.5■■■■□ 3.59
GAPVD1Q14C86 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
GAPVD1Q14C86 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
GAPVD1Q14C86 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC37.5■■■■□ 3.59
GAPVD1Q14C86 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
GAPVD1Q14C86 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
GAPVD1Q14C86 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC37.49■■■■□ 3.59
GAPVD1Q14C86 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
GAPVD1Q14C86 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC37.49■■■■□ 3.59
GAPVD1Q14C86 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
GAPVD1Q14C86 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC37.48■■■■□ 3.59
GAPVD1Q14C86 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC37.48■■■■□ 3.59
GAPVD1Q14C86 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC37.48■■■■□ 3.59
GAPVD1Q14C86 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
GAPVD1Q14C86 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
GAPVD1Q14C86 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.47■■■■□ 3.59
GAPVD1Q14C86 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
GAPVD1Q14C86 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.47■■■■□ 3.59
GAPVD1Q14C86 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC37.47■■■■□ 3.59
GAPVD1Q14C86 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.47■■■■□ 3.59
GAPVD1Q14C86 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC37.47■■■■□ 3.59
GAPVD1Q14C86 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
GAPVD1Q14C86 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC37.46■■■■□ 3.59
GAPVD1Q14C86 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC37.46■■■■□ 3.59
GAPVD1Q14C86 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
GAPVD1Q14C86 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
GAPVD1Q14C86 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC37.46■■■■□ 3.59
GAPVD1Q14C86 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC37.46■■■■□ 3.59
GAPVD1Q14C86 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
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