Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMCO1Q147U7 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMCO1Q147U7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SMCO1Q147U7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMCO1Q147U7 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMCO1Q147U7 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMCO1Q147U7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMCO1Q147U7 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SMCO1Q147U7 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SMCO1Q147U7 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SMCO1Q147U7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMCO1Q147U7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMCO1Q147U7 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMCO1Q147U7 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMCO1Q147U7 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMCO1Q147U7 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMCO1Q147U7 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMCO1Q147U7 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMCO1Q147U7 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMCO1Q147U7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMCO1Q147U7 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMCO1Q147U7 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMCO1Q147U7 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMCO1Q147U7 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMCO1Q147U7 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMCO1Q147U7 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMCO1Q147U7 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMCO1Q147U7 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMCO1Q147U7 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMCO1Q147U7 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMCO1Q147U7 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SMCO1Q147U7 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMCO1Q147U7 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMCO1Q147U7 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMCO1Q147U7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMCO1Q147U7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMCO1Q147U7 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMCO1Q147U7 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMCO1Q147U7 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMCO1Q147U7 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMCO1Q147U7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMCO1Q147U7 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SMCO1Q147U7 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMCO1Q147U7 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMCO1Q147U7 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMCO1Q147U7 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMCO1Q147U7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMCO1Q147U7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMCO1Q147U7 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMCO1Q147U7 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMCO1Q147U7 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMCO1Q147U7 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMCO1Q147U7 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMCO1Q147U7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMCO1Q147U7 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMCO1Q147U7 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMCO1Q147U7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMCO1Q147U7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMCO1Q147U7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMCO1Q147U7 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMCO1Q147U7 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMCO1Q147U7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMCO1Q147U7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMCO1Q147U7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SMCO1Q147U7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SMCO1Q147U7 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMCO1Q147U7 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMCO1Q147U7 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMCO1Q147U7 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMCO1Q147U7 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMCO1Q147U7 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMCO1Q147U7 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SMCO1Q147U7 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMCO1Q147U7 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMCO1Q147U7 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMCO1Q147U7 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMCO1Q147U7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMCO1Q147U7 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMCO1Q147U7 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMCO1Q147U7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMCO1Q147U7 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMCO1Q147U7 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMCO1Q147U7 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMCO1Q147U7 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMCO1Q147U7 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMCO1Q147U7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMCO1Q147U7 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMCO1Q147U7 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMCO1Q147U7 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMCO1Q147U7 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMCO1Q147U7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMCO1Q147U7 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMCO1Q147U7 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMCO1Q147U7 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMCO1Q147U7 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMCO1Q147U7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SMCO1Q147U7 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMCO1Q147U7 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMCO1Q147U7 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMCO1Q147U7 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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