Protein–RNA interactions for Protein: Q14676

MDC1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDC1Q14676 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MDC1Q14676 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MDC1Q14676 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MDC1Q14676 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MDC1Q14676 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MDC1Q14676 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MDC1Q14676 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MDC1Q14676 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MDC1Q14676 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MDC1Q14676 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MDC1Q14676 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MDC1Q14676 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MDC1Q14676 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MDC1Q14676 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
MDC1Q14676 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MDC1Q14676 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MDC1Q14676 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MDC1Q14676 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MDC1Q14676 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MDC1Q14676 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MDC1Q14676 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MDC1Q14676 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MDC1Q14676 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MDC1Q14676 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MDC1Q14676 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MDC1Q14676 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MDC1Q14676 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MDC1Q14676 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MDC1Q14676 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
MDC1Q14676 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MDC1Q14676 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MDC1Q14676 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MDC1Q14676 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MDC1Q14676 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MDC1Q14676 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
MDC1Q14676 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MDC1Q14676 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MDC1Q14676 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MDC1Q14676 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MDC1Q14676 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MDC1Q14676 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MDC1Q14676 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MDC1Q14676 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MDC1Q14676 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MDC1Q14676 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MDC1Q14676 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MDC1Q14676 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MDC1Q14676 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MDC1Q14676 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MDC1Q14676 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
MDC1Q14676 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MDC1Q14676 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MDC1Q14676 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MDC1Q14676 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MDC1Q14676 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MDC1Q14676 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MDC1Q14676 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MDC1Q14676 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MDC1Q14676 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MDC1Q14676 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MDC1Q14676 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MDC1Q14676 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MDC1Q14676 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MDC1Q14676 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MDC1Q14676 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MDC1Q14676 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MDC1Q14676 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MDC1Q14676 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MDC1Q14676 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MDC1Q14676 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MDC1Q14676 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MDC1Q14676 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MDC1Q14676 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
MDC1Q14676 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
MDC1Q14676 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MDC1Q14676 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MDC1Q14676 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MDC1Q14676 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MDC1Q14676 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MDC1Q14676 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MDC1Q14676 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MDC1Q14676 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
MDC1Q14676 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MDC1Q14676 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MDC1Q14676 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MDC1Q14676 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MDC1Q14676 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MDC1Q14676 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MDC1Q14676 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
MDC1Q14676 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MDC1Q14676 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MDC1Q14676 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MDC1Q14676 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MDC1Q14676 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MDC1Q14676 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MDC1Q14676 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MDC1Q14676 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MDC1Q14676 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
MDC1Q14676 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MDC1Q14676 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
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