Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

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Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNA1CQ13936 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNA1CQ13936 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNA1CQ13936 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNA1CQ13936 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNA1CQ13936 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNA1CQ13936 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNA1CQ13936 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNA1CQ13936 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNA1CQ13936 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNA1CQ13936 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNA1CQ13936 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNA1CQ13936 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNA1CQ13936 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNA1CQ13936 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNA1CQ13936 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNA1CQ13936 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNA1CQ13936 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNA1CQ13936 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNA1CQ13936 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNA1CQ13936 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNA1CQ13936 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNA1CQ13936 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNA1CQ13936 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNA1CQ13936 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNA1CQ13936 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNA1CQ13936 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNA1CQ13936 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNA1CQ13936 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNA1CQ13936 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNA1CQ13936 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNA1CQ13936 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNA1CQ13936 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNA1CQ13936 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNA1CQ13936 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNA1CQ13936 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNA1CQ13936 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNA1CQ13936 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNA1CQ13936 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNA1CQ13936 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNA1CQ13936 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNA1CQ13936 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNA1CQ13936 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNA1CQ13936 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNA1CQ13936 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNA1CQ13936 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNA1CQ13936 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNA1CQ13936 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNA1CQ13936 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNA1CQ13936 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNA1CQ13936 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNA1CQ13936 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNA1CQ13936 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNA1CQ13936 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNA1CQ13936 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNA1CQ13936 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNA1CQ13936 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNA1CQ13936 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNA1CQ13936 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNA1CQ13936 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNA1CQ13936 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNA1CQ13936 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNA1CQ13936 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNA1CQ13936 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNA1CQ13936 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNA1CQ13936 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNA1CQ13936 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNA1CQ13936 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CACNA1CQ13936 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CACNA1CQ13936 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CACNA1CQ13936 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CACNA1CQ13936 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CACNA1CQ13936 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CACNA1CQ13936 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CACNA1CQ13936 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CACNA1CQ13936 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CACNA1CQ13936 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CACNA1CQ13936 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CACNA1CQ13936 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CACNA1CQ13936 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNA1CQ13936 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNA1CQ13936 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNA1CQ13936 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNA1CQ13936 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNA1CQ13936 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNA1CQ13936 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNA1CQ13936 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNA1CQ13936 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNA1CQ13936 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNA1CQ13936 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNA1CQ13936 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNA1CQ13936 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNA1CQ13936 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNA1CQ13936 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNA1CQ13936 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNA1CQ13936 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNA1CQ13936 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNA1CQ13936 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNA1CQ13936 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNA1CQ13936 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
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