Protein–RNA interactions for Protein: Q13404

UBE2V1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2V1Q13404 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
UBE2V1Q13404 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
UBE2V1Q13404 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
UBE2V1Q13404 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
UBE2V1Q13404 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
UBE2V1Q13404 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2V1Q13404 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2V1Q13404 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2V1Q13404 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2V1Q13404 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2V1Q13404 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2V1Q13404 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2V1Q13404 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2V1Q13404 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2V1Q13404 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2V1Q13404 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2V1Q13404 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2V1Q13404 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2V1Q13404 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2V1Q13404 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2V1Q13404 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2V1Q13404 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2V1Q13404 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2V1Q13404 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2V1Q13404 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2V1Q13404 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2V1Q13404 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2V1Q13404 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2V1Q13404 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2V1Q13404 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2V1Q13404 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2V1Q13404 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2V1Q13404 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2V1Q13404 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2V1Q13404 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2V1Q13404 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2V1Q13404 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2V1Q13404 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2V1Q13404 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2V1Q13404 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2V1Q13404 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2V1Q13404 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2V1Q13404 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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UBE2V1Q13404 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2V1Q13404 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2V1Q13404 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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UBE2V1Q13404 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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UBE2V1Q13404 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2V1Q13404 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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UBE2V1Q13404 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2V1Q13404 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2V1Q13404 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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UBE2V1Q13404 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2V1Q13404 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2V1Q13404 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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UBE2V1Q13404 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2V1Q13404 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
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UBE2V1Q13404 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBE2V1Q13404 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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UBE2V1Q13404 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBE2V1Q13404 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBE2V1Q13404 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBE2V1Q13404 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBE2V1Q13404 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBE2V1Q13404 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBE2V1Q13404 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
UBE2V1Q13404 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
UBE2V1Q13404 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
UBE2V1Q13404 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
UBE2V1Q13404 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
UBE2V1Q13404 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
UBE2V1Q13404 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
UBE2V1Q13404 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
UBE2V1Q13404 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
UBE2V1Q13404 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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UBE2V1Q13404 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
UBE2V1Q13404 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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