Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

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Length 729 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
TRDNQ13061 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRDNQ13061 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRDNQ13061 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRDNQ13061 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRDNQ13061 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRDNQ13061 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRDNQ13061 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRDNQ13061 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRDNQ13061 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRDNQ13061 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
TRDNQ13061 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TRDNQ13061 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRDNQ13061 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRDNQ13061 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRDNQ13061 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRDNQ13061 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRDNQ13061 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRDNQ13061 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRDNQ13061 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRDNQ13061 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRDNQ13061 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRDNQ13061 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRDNQ13061 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRDNQ13061 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRDNQ13061 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRDNQ13061 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRDNQ13061 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRDNQ13061 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRDNQ13061 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRDNQ13061 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRDNQ13061 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRDNQ13061 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRDNQ13061 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRDNQ13061 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRDNQ13061 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRDNQ13061 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRDNQ13061 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRDNQ13061 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRDNQ13061 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRDNQ13061 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRDNQ13061 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRDNQ13061 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRDNQ13061 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRDNQ13061 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRDNQ13061 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRDNQ13061 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRDNQ13061 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRDNQ13061 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRDNQ13061 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRDNQ13061 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRDNQ13061 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRDNQ13061 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRDNQ13061 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRDNQ13061 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
TRDNQ13061 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRDNQ13061 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
TRDNQ13061 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRDNQ13061 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRDNQ13061 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRDNQ13061 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRDNQ13061 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRDNQ13061 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRDNQ13061 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRDNQ13061 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
TRDNQ13061 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
TRDNQ13061 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRDNQ13061 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRDNQ13061 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRDNQ13061 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRDNQ13061 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRDNQ13061 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRDNQ13061 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRDNQ13061 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRDNQ13061 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRDNQ13061 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRDNQ13061 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRDNQ13061 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRDNQ13061 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRDNQ13061 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRDNQ13061 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRDNQ13061 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRDNQ13061 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRDNQ13061 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
TRDNQ13061 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
TRDNQ13061 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRDNQ13061 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRDNQ13061 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRDNQ13061 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRDNQ13061 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRDNQ13061 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRDNQ13061 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRDNQ13061 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRDNQ13061 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRDNQ13061 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRDNQ13061 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRDNQ13061 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRDNQ13061 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRDNQ13061 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRDNQ13061 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
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