Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOXC1Q12948 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOXC1Q12948 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOXC1Q12948 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOXC1Q12948 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOXC1Q12948 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOXC1Q12948 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOXC1Q12948 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOXC1Q12948 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOXC1Q12948 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOXC1Q12948 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
FOXC1Q12948 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXC1Q12948 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXC1Q12948 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXC1Q12948 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXC1Q12948 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXC1Q12948 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXC1Q12948 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXC1Q12948 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXC1Q12948 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXC1Q12948 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXC1Q12948 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXC1Q12948 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXC1Q12948 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXC1Q12948 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXC1Q12948 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXC1Q12948 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXC1Q12948 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXC1Q12948 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXC1Q12948 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXC1Q12948 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXC1Q12948 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXC1Q12948 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXC1Q12948 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXC1Q12948 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXC1Q12948 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXC1Q12948 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXC1Q12948 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FOXC1Q12948 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FOXC1Q12948 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FOXC1Q12948 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FOXC1Q12948 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FOXC1Q12948 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FOXC1Q12948 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
FOXC1Q12948 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FOXC1Q12948 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FOXC1Q12948 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FOXC1Q12948 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FOXC1Q12948 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
FOXC1Q12948 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FOXC1Q12948 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FOXC1Q12948 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FOXC1Q12948 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FOXC1Q12948 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FOXC1Q12948 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FOXC1Q12948 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FOXC1Q12948 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FOXC1Q12948 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FOXC1Q12948 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FOXC1Q12948 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FOXC1Q12948 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FOXC1Q12948 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FOXC1Q12948 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FOXC1Q12948 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FOXC1Q12948 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FOXC1Q12948 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
FOXC1Q12948 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FOXC1Q12948 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
FOXC1Q12948 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FOXC1Q12948 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FOXC1Q12948 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
FOXC1Q12948 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FOXC1Q12948 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FOXC1Q12948 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FOXC1Q12948 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FOXC1Q12948 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FOXC1Q12948 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FOXC1Q12948 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FOXC1Q12948 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
FOXC1Q12948 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FOXC1Q12948 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FOXC1Q12948 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FOXC1Q12948 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FOXC1Q12948 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FOXC1Q12948 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FOXC1Q12948 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
FOXC1Q12948 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FOXC1Q12948 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FOXC1Q12948 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
FOXC1Q12948 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FOXC1Q12948 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FOXC1Q12948 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
FOXC1Q12948 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FOXC1Q12948 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FOXC1Q12948 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FOXC1Q12948 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FOXC1Q12948 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FOXC1Q12948 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FOXC1Q12948 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FOXC1Q12948 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
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