Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FOXF2Q12947 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FOXF2Q12947 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FOXF2Q12947 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FOXF2Q12947 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FOXF2Q12947 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FOXF2Q12947 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FOXF2Q12947 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FOXF2Q12947 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FOXF2Q12947 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FOXF2Q12947 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
FOXF2Q12947 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FOXF2Q12947 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FOXF2Q12947 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
FOXF2Q12947 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FOXF2Q12947 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FOXF2Q12947 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FOXF2Q12947 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FOXF2Q12947 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
FOXF2Q12947 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FOXF2Q12947 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
FOXF2Q12947 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FOXF2Q12947 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FOXF2Q12947 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FOXF2Q12947 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FOXF2Q12947 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FOXF2Q12947 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FOXF2Q12947 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FOXF2Q12947 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FOXF2Q12947 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FOXF2Q12947 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FOXF2Q12947 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FOXF2Q12947 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FOXF2Q12947 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
FOXF2Q12947 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FOXF2Q12947 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FOXF2Q12947 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
FOXF2Q12947 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FOXF2Q12947 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
FOXF2Q12947 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
FOXF2Q12947 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FOXF2Q12947 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FOXF2Q12947 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
FOXF2Q12947 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FOXF2Q12947 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FOXF2Q12947 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FOXF2Q12947 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FOXF2Q12947 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FOXF2Q12947 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
FOXF2Q12947 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
FOXF2Q12947 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FOXF2Q12947 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FOXF2Q12947 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FOXF2Q12947 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FOXF2Q12947 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
FOXF2Q12947 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FOXF2Q12947 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FOXF2Q12947 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FOXF2Q12947 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
FOXF2Q12947 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FOXF2Q12947 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
FOXF2Q12947 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
FOXF2Q12947 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FOXF2Q12947 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FOXF2Q12947 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
FOXF2Q12947 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
FOXF2Q12947 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
FOXF2Q12947 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
FOXF2Q12947 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FOXF2Q12947 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FOXF2Q12947 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FOXF2Q12947 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FOXF2Q12947 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FOXF2Q12947 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FOXF2Q12947 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FOXF2Q12947 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
FOXF2Q12947 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FOXF2Q12947 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
FOXF2Q12947 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FOXF2Q12947 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
FOXF2Q12947 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
FOXF2Q12947 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FOXF2Q12947 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FOXF2Q12947 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
FOXF2Q12947 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FOXF2Q12947 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FOXF2Q12947 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FOXF2Q12947 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FOXF2Q12947 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
FOXF2Q12947 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FOXF2Q12947 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FOXF2Q12947 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FOXF2Q12947 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FOXF2Q12947 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FOXF2Q12947 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FOXF2Q12947 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FOXF2Q12947 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FOXF2Q12947 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FOXF2Q12947 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FOXF2Q12947 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
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