Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LTBQ06643 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LTBQ06643 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LTBQ06643 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LTBQ06643 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LTBQ06643 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LTBQ06643 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LTBQ06643 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LTBQ06643 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LTBQ06643 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LTBQ06643 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
LTBQ06643 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LTBQ06643 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LTBQ06643 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
LTBQ06643 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LTBQ06643 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LTBQ06643 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LTBQ06643 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LTBQ06643 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LTBQ06643 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LTBQ06643 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LTBQ06643 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LTBQ06643 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LTBQ06643 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LTBQ06643 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LTBQ06643 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LTBQ06643 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LTBQ06643 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LTBQ06643 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LTBQ06643 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LTBQ06643 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LTBQ06643 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LTBQ06643 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LTBQ06643 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LTBQ06643 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LTBQ06643 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LTBQ06643 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LTBQ06643 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LTBQ06643 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LTBQ06643 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LTBQ06643 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LTBQ06643 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LTBQ06643 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LTBQ06643 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LTBQ06643 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LTBQ06643 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LTBQ06643 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LTBQ06643 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LTBQ06643 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LTBQ06643 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LTBQ06643 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LTBQ06643 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LTBQ06643 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LTBQ06643 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LTBQ06643 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LTBQ06643 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LTBQ06643 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LTBQ06643 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LTBQ06643 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LTBQ06643 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LTBQ06643 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
LTBQ06643 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LTBQ06643 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LTBQ06643 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LTBQ06643 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LTBQ06643 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LTBQ06643 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LTBQ06643 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LTBQ06643 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
LTBQ06643 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LTBQ06643 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LTBQ06643 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LTBQ06643 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LTBQ06643 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LTBQ06643 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
LTBQ06643 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
LTBQ06643 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
LTBQ06643 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
LTBQ06643 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
LTBQ06643 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
LTBQ06643 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LTBQ06643 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LTBQ06643 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LTBQ06643 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LTBQ06643 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LTBQ06643 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LTBQ06643 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
LTBQ06643 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LTBQ06643 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LTBQ06643 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LTBQ06643 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LTBQ06643 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LTBQ06643 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LTBQ06643 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LTBQ06643 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LTBQ06643 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LTBQ06643 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LTBQ06643 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LTBQ06643 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LTBQ06643 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms