Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GABPB1Q06547 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GABPB1Q06547 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GABPB1Q06547 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GABPB1Q06547 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GABPB1Q06547 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GABPB1Q06547 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GABPB1Q06547 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GABPB1Q06547 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GABPB1Q06547 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GABPB1Q06547 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GABPB1Q06547 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GABPB1Q06547 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GABPB1Q06547 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GABPB1Q06547 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GABPB1Q06547 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GABPB1Q06547 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GABPB1Q06547 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GABPB1Q06547 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GABPB1Q06547 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GABPB1Q06547 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GABPB1Q06547 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GABPB1Q06547 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GABPB1Q06547 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GABPB1Q06547 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GABPB1Q06547 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GABPB1Q06547 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GABPB1Q06547 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GABPB1Q06547 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GABPB1Q06547 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
GABPB1Q06547 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GABPB1Q06547 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GABPB1Q06547 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GABPB1Q06547 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GABPB1Q06547 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GABPB1Q06547 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GABPB1Q06547 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GABPB1Q06547 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GABPB1Q06547 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GABPB1Q06547 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GABPB1Q06547 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GABPB1Q06547 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GABPB1Q06547 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GABPB1Q06547 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GABPB1Q06547 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GABPB1Q06547 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GABPB1Q06547 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GABPB1Q06547 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GABPB1Q06547 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GABPB1Q06547 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GABPB1Q06547 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GABPB1Q06547 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GABPB1Q06547 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GABPB1Q06547 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GABPB1Q06547 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GABPB1Q06547 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GABPB1Q06547 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GABPB1Q06547 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GABPB1Q06547 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GABPB1Q06547 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GABPB1Q06547 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GABPB1Q06547 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GABPB1Q06547 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GABPB1Q06547 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GABPB1Q06547 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GABPB1Q06547 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GABPB1Q06547 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GABPB1Q06547 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GABPB1Q06547 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GABPB1Q06547 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GABPB1Q06547 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GABPB1Q06547 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GABPB1Q06547 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GABPB1Q06547 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GABPB1Q06547 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GABPB1Q06547 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GABPB1Q06547 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GABPB1Q06547 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GABPB1Q06547 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GABPB1Q06547 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GABPB1Q06547 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GABPB1Q06547 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GABPB1Q06547 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GABPB1Q06547 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GABPB1Q06547 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GABPB1Q06547 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GABPB1Q06547 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GABPB1Q06547 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GABPB1Q06547 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
GABPB1Q06547 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GABPB1Q06547 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GABPB1Q06547 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
GABPB1Q06547 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GABPB1Q06547 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GABPB1Q06547 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GABPB1Q06547 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GABPB1Q06547 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GABPB1Q06547 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GABPB1Q06547 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GABPB1Q06547 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms