Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CENPCQ03188 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CENPCQ03188 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CENPCQ03188 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CENPCQ03188 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CENPCQ03188 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CENPCQ03188 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CENPCQ03188 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CENPCQ03188 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CENPCQ03188 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CENPCQ03188 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CENPCQ03188 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CENPCQ03188 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CENPCQ03188 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CENPCQ03188 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CENPCQ03188 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CENPCQ03188 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CENPCQ03188 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CENPCQ03188 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CENPCQ03188 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CENPCQ03188 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CENPCQ03188 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CENPCQ03188 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CENPCQ03188 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CENPCQ03188 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CENPCQ03188 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CENPCQ03188 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CENPCQ03188 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CENPCQ03188 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CENPCQ03188 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CENPCQ03188 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CENPCQ03188 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CENPCQ03188 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CENPCQ03188 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CENPCQ03188 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CENPCQ03188 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CENPCQ03188 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CENPCQ03188 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CENPCQ03188 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CENPCQ03188 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CENPCQ03188 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CENPCQ03188 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CENPCQ03188 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CENPCQ03188 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CENPCQ03188 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CENPCQ03188 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CENPCQ03188 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CENPCQ03188 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CENPCQ03188 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CENPCQ03188 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CENPCQ03188 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CENPCQ03188 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CENPCQ03188 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CENPCQ03188 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CENPCQ03188 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CENPCQ03188 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CENPCQ03188 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CENPCQ03188 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CENPCQ03188 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CENPCQ03188 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CENPCQ03188 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CENPCQ03188 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CENPCQ03188 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CENPCQ03188 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CENPCQ03188 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CENPCQ03188 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CENPCQ03188 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CENPCQ03188 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CENPCQ03188 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CENPCQ03188 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CENPCQ03188 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CENPCQ03188 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CENPCQ03188 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CENPCQ03188 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CENPCQ03188 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CENPCQ03188 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CENPCQ03188 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CENPCQ03188 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CENPCQ03188 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CENPCQ03188 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CENPCQ03188 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CENPCQ03188 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CENPCQ03188 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CENPCQ03188 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CENPCQ03188 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CENPCQ03188 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CENPCQ03188 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CENPCQ03188 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CENPCQ03188 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CENPCQ03188 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CENPCQ03188 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CENPCQ03188 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CENPCQ03188 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CENPCQ03188 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CENPCQ03188 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CENPCQ03188 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CENPCQ03188 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CENPCQ03188 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CENPCQ03188 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CENPCQ03188 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms