Protein–RNA interactions for Protein: Q02297

NRG1, Pro-neuregulin-1, membrane-bound isoform, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRG1Q02297 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
NRG1Q02297 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NRG1Q02297 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NRG1Q02297 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NRG1Q02297 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NRG1Q02297 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NRG1Q02297 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NRG1Q02297 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NRG1Q02297 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NRG1Q02297 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NRG1Q02297 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NRG1Q02297 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NRG1Q02297 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NRG1Q02297 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NRG1Q02297 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NRG1Q02297 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NRG1Q02297 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NRG1Q02297 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NRG1Q02297 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NRG1Q02297 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NRG1Q02297 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NRG1Q02297 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NRG1Q02297 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NRG1Q02297 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NRG1Q02297 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NRG1Q02297 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NRG1Q02297 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NRG1Q02297 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NRG1Q02297 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NRG1Q02297 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NRG1Q02297 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
NRG1Q02297 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
NRG1Q02297 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
NRG1Q02297 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NRG1Q02297 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NRG1Q02297 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NRG1Q02297 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NRG1Q02297 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NRG1Q02297 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NRG1Q02297 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NRG1Q02297 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NRG1Q02297 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NRG1Q02297 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NRG1Q02297 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NRG1Q02297 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NRG1Q02297 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NRG1Q02297 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NRG1Q02297 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NRG1Q02297 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NRG1Q02297 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NRG1Q02297 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NRG1Q02297 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NRG1Q02297 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NRG1Q02297 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NRG1Q02297 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NRG1Q02297 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NRG1Q02297 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NRG1Q02297 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NRG1Q02297 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NRG1Q02297 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NRG1Q02297 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NRG1Q02297 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NRG1Q02297 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NRG1Q02297 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NRG1Q02297 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NRG1Q02297 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NRG1Q02297 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NRG1Q02297 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NRG1Q02297 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NRG1Q02297 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NRG1Q02297 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NRG1Q02297 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NRG1Q02297 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NRG1Q02297 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NRG1Q02297 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
NRG1Q02297 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
NRG1Q02297 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NRG1Q02297 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NRG1Q02297 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NRG1Q02297 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NRG1Q02297 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NRG1Q02297 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NRG1Q02297 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NRG1Q02297 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NRG1Q02297 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NRG1Q02297 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NRG1Q02297 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NRG1Q02297 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NRG1Q02297 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NRG1Q02297 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NRG1Q02297 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NRG1Q02297 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NRG1Q02297 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NRG1Q02297 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NRG1Q02297 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NRG1Q02297 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NRG1Q02297 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NRG1Q02297 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NRG1Q02297 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NRG1Q02297 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms