Protein–RNA interactions for Protein: Q01085

TIAL1, Nucleolysin TIAR, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIAL1Q01085 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.622e-6■■■■□ 22
TIAL1Q01085 FOXP1-207ENST00000471386 299 ntTSL 1 (best)24.67■■□□□ 1.542e-6■■■■□ 22
TIAL1Q01085 FOXP1-217ENST00000498154 535 ntTSL 323.23■■□□□ 1.312e-6■■■■□ 22
TIAL1Q01085 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.182e-6■■■■□ 22
TIAL1Q01085 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.152e-6■■■■□ 22
TIAL1Q01085 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.132e-6■■■■□ 22
TIAL1Q01085 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.052e-6■■■■□ 22
TIAL1Q01085 LUC7L-219ENST00000494545 725 ntTSL 521.43■■□□□ 1.022e-6■■■■□ 22
TIAL1Q01085 STARD3-214ENST00000578577 1511 ntTSL 220.98■□□□□ 0.952e-6■■■■□ 22
TIAL1Q01085 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.842e-6■■■■□ 22
TIAL1Q01085 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.832e-6■■■■□ 22
TIAL1Q01085 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.812e-6■■■■□ 22
TIAL1Q01085 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.732e-6■■■■□ 22
TIAL1Q01085 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.72e-6■■■■□ 22
TIAL1Q01085 LUC7L-207ENST00000426094 2737 ntTSL 1 (best)19.41■□□□□ 0.72e-6■■■■□ 22
TIAL1Q01085 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.682e-6■■■■□ 22
TIAL1Q01085 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.652e-6■■■■□ 22
TIAL1Q01085 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.632e-6■■■■□ 22
TIAL1Q01085 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.582e-6■■■■□ 22
TIAL1Q01085 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.562e-6■■■■□ 22
TIAL1Q01085 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.542e-6■■■■□ 22
TIAL1Q01085 BAIAP2-225ENST00000576225 2316 ntTSL 218.33■□□□□ 0.532e-6■■■■□ 22
TIAL1Q01085 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.522e-6■■■■□ 22
TIAL1Q01085 LUC7L-218ENST00000494366 668 ntTSL 318.27■□□□□ 0.522e-6■■■■□ 22
TIAL1Q01085 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.52e-6■■■■□ 22
TIAL1Q01085 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.472e-6■■■■□ 22
TIAL1Q01085 STARD3-223ENST00000583582 1350 ntTSL 217.81■□□□□ 0.442e-6■■■■□ 22
TIAL1Q01085 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.442e-6■■■■□ 22
TIAL1Q01085 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.432e-6■■■■□ 22
TIAL1Q01085 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.392e-6■■■■□ 22
TIAL1Q01085 CDC27-203ENST00000526866 1420 ntTSL 217.36■□□□□ 0.372e-6■■■■□ 22
TIAL1Q01085 SPTAN1-217ENST00000629089 1546 ntTSL 217.36■□□□□ 0.372e-6■■■■□ 22
TIAL1Q01085 STARD3-210ENST00000577248 571 ntTSL 417.24■□□□□ 0.352e-6■■■■□ 22
TIAL1Q01085 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.312e-6■■■■□ 22
TIAL1Q01085 ZNF436-AS1-204ENST00000458053 375 ntTSL 216.8■□□□□ 0.282e-6■■■■□ 22
TIAL1Q01085 SPTAN1-214ENST00000628614 993 ntTSL 1 (best)16.41■□□□□ 0.222e-6■■■■□ 22
TIAL1Q01085 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.22e-6■■■■□ 22
TIAL1Q01085 STARD3-203ENST00000443521 673 ntTSL 516.27■□□□□ 0.22e-6■■■■□ 22
TIAL1Q01085 LUC7L-214ENST00000467552 569 ntTSL 1 (best)16.23■□□□□ 0.192e-6■■■■□ 22
TIAL1Q01085 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.182e-6■■■■□ 22
TIAL1Q01085 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.182e-6■■■■□ 22
TIAL1Q01085 STARD3-207ENST00000484773 916 ntTSL 315.99■□□□□ 0.152e-6■■■■□ 22
TIAL1Q01085 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.142e-6■■■■□ 22
TIAL1Q01085 STARD3-228ENST00000585214 566 ntTSL 415.74■□□□□ 0.112e-6■■■■□ 22
TIAL1Q01085 STARD3-221ENST00000582874 591 ntTSL 315.66■□□□□ 0.12e-6■■■■□ 22
TIAL1Q01085 BAIAP2-209ENST00000572329 2133 ntTSL 215.58■□□□□ 0.082e-6■■■■□ 22
TIAL1Q01085 BAIAP2-210ENST00000572498 858 ntTSL 215.52■□□□□ 0.082e-6■■■■□ 22
TIAL1Q01085 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.042e-6■■■■□ 22
TIAL1Q01085 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 02e-6■■■■□ 22
TIAL1Q01085 STARD3-222ENST00000583419 579 ntTSL 415.06■□□□□ 02e-6■■■■□ 22
TIAL1Q01085 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.032e-6■■■■□ 22
TIAL1Q01085 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.062e-6■■■■□ 22
TIAL1Q01085 STARD3-208ENST00000488876 2404 ntTSL 214.68□□□□□ -0.062e-6■■■■□ 22
TIAL1Q01085 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.072e-6■■■■□ 22
TIAL1Q01085 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.072e-6■■■■□ 22
TIAL1Q01085 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.132e-6■■■■□ 22
TIAL1Q01085 STARD3-211ENST00000578232 851 ntTSL 214.09□□□□□ -0.152e-6■■■■□ 22
TIAL1Q01085 LUC7L-217ENST00000490762 2643 ntTSL 1 (best)13.61□□□□□ -0.232e-6■■■■□ 22
TIAL1Q01085 UBE2A-206ENST00000625938 1381 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.242e-6■■■■□ 22
TIAL1Q01085 XBP1-204ENST00000405219 1690 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.242e-6■■■■□ 22
TIAL1Q01085 CDC27-210ENST00000533415 2570 ntTSL 213.46□□□□□ -0.252e-6■■■■□ 22
TIAL1Q01085 LUC7L-206ENST00000419516 1211 ntTSL 513.45□□□□□ -0.262e-6■■■■□ 22
TIAL1Q01085 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.272e-6■■■■□ 22
TIAL1Q01085 CDC27-209ENST00000532893 515 ntTSL 313.35□□□□□ -0.272e-6■■■■□ 22
TIAL1Q01085 CDC27-205ENST00000528147 463 ntTSL 413.15□□□□□ -0.32e-6■■■■□ 22
TIAL1Q01085 CDC27-217ENST00000575483 781 ntTSL 513.15□□□□□ -0.32e-6■■■■□ 22
TIAL1Q01085 BAIAP2-202ENST00000321300 2879 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.312e-6■■■■□ 22
TIAL1Q01085 BAIAP2-229ENST00000576995 3689 ntTSL 213.06□□□□□ -0.322e-6■■■■□ 22
TIAL1Q01085 UBE2A-210ENST00000630695 1771 ntTSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.322e-6■■■■□ 22
TIAL1Q01085 SCAF4-201ENST00000286835 4193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.332e-6■■■■□ 22
TIAL1Q01085 ZNF436-AS1-201ENST00000335648 2547 ntBASIC12.68□□□□□ -0.382e-6■■■■□ 22
TIAL1Q01085 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.392e-6■■■■□ 22
TIAL1Q01085 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.392e-6■■■■□ 22
TIAL1Q01085 AC006001.2-202ENST00000439360 508 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.422e-6■■■■□ 22
TIAL1Q01085 RABGEF1-211ENST00000503687 4139 ntTSL 212.31□□□□□ -0.442e-6■■■■□ 22
TIAL1Q01085 BAIAP2-222ENST00000575841 509 ntTSL 212.28□□□□□ -0.442e-6■■■■□ 22
TIAL1Q01085 CHST15-201ENST00000346248 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.472e-6■■■■□ 22
TIAL1Q01085 UBE2A-211ENST00000631185 1435 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.472e-6■■■■□ 22
TIAL1Q01085 UBE2A-204ENST00000469205 686 ntTSL 211.89□□□□□ -0.512e-6■■■■□ 22
TIAL1Q01085 LUC7L-210ENST00000430864 695 ntTSL 511.79□□□□□ -0.522e-6■■■■□ 22
TIAL1Q01085 LUC7L-205ENST00000418978 989 ntTSL 511.73□□□□□ -0.532e-6■■■■□ 22
TIAL1Q01085 CHST15-202ENST00000435907 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.532e-6■■■■□ 22
TIAL1Q01085 XBP1-206ENST00000484256 2173 ntTSL 211.69□□□□□ -0.542e-6■■■■□ 22
TIAL1Q01085 TMCO3-205ENST00000465556 314 ntTSL 311.52□□□□□ -0.572e-6■■■■□ 22
TIAL1Q01085 CDC27-202ENST00000525495 1459 ntTSL 511.45□□□□□ -0.582e-6■■■■□ 22
TIAL1Q01085 AC006001.2-203ENST00000428557 304 ntTSL 311.33□□□□□ -0.62e-6■■■■□ 22
TIAL1Q01085 TBP-201ENST00000230354 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.612e-6■■■■□ 22
TIAL1Q01085 LUC7L-208ENST00000428363 498 ntTSL 511□□□□□ -0.652e-6■■■■□ 22
TIAL1Q01085 STARD3-206ENST00000481171 3451 ntTSL 210.64□□□□□ -0.712e-6■■■■□ 22
TIAL1Q01085 UBE2A-201ENST00000346330 718 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.752e-6■■■■□ 22
TIAL1Q01085 TBP-203ENST00000421512 935 ntTSL 1 (best)10.36□□□□□ -0.752e-6■■■■□ 22
TIAL1Q01085 SCAF4-203ENST00000434667 3846 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.752e-6■■■■□ 22
TIAL1Q01085 UBE2A-209ENST00000629303 557 ntTSL 410.1□□□□□ -0.792e-6■■■■□ 22
TIAL1Q01085 SPTAN1-201ENST00000358161 7794 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.942e-6■■■■□ 22
TIAL1Q01085 CDC27-204ENST00000527547 2579 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.952e-6■■■■□ 22
TIAL1Q01085 TMEM140-202ENST00000466307 392 ntTSL 58.78□□□□□ -12e-6■■■■□ 22
TIAL1Q01085 SPTAN1-203ENST00000372739 7868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.082e-6■■■■□ 22
TIAL1Q01085 CDC27-201ENST00000066544 5801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.092e-6■■■■□ 22
TIAL1Q01085 SPTAN1-202ENST00000372731 7889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.122e-6■■■■□ 22
TIAL1Q01085 CDC27-208ENST00000532575 765 ntTSL 37.56□□□□□ -1.22e-6■■■■□ 22
Retrieved 100 of 8,119 protein–RNA pairs in 939.1 ms