Protein–RNA interactions for Protein: Q00973

B4GALNT1, Beta-1,4 N-acetylgalactosaminyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4GALNT1Q00973 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
B4GALNT1Q00973 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
B4GALNT1Q00973 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
B4GALNT1Q00973 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
B4GALNT1Q00973 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
B4GALNT1Q00973 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
B4GALNT1Q00973 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
B4GALNT1Q00973 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
B4GALNT1Q00973 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
B4GALNT1Q00973 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
B4GALNT1Q00973 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
B4GALNT1Q00973 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
B4GALNT1Q00973 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
B4GALNT1Q00973 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
B4GALNT1Q00973 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
B4GALNT1Q00973 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
B4GALNT1Q00973 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
B4GALNT1Q00973 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
B4GALNT1Q00973 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
B4GALNT1Q00973 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
B4GALNT1Q00973 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
B4GALNT1Q00973 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
B4GALNT1Q00973 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
B4GALNT1Q00973 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
B4GALNT1Q00973 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
B4GALNT1Q00973 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
B4GALNT1Q00973 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
B4GALNT1Q00973 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
B4GALNT1Q00973 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
B4GALNT1Q00973 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
B4GALNT1Q00973 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
B4GALNT1Q00973 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
B4GALNT1Q00973 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
B4GALNT1Q00973 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
B4GALNT1Q00973 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
B4GALNT1Q00973 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
B4GALNT1Q00973 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
B4GALNT1Q00973 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
B4GALNT1Q00973 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
B4GALNT1Q00973 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
B4GALNT1Q00973 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
B4GALNT1Q00973 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
B4GALNT1Q00973 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
B4GALNT1Q00973 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
B4GALNT1Q00973 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
B4GALNT1Q00973 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
B4GALNT1Q00973 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
B4GALNT1Q00973 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
B4GALNT1Q00973 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
B4GALNT1Q00973 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
B4GALNT1Q00973 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
B4GALNT1Q00973 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
B4GALNT1Q00973 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
B4GALNT1Q00973 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
B4GALNT1Q00973 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
B4GALNT1Q00973 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
B4GALNT1Q00973 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
B4GALNT1Q00973 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
B4GALNT1Q00973 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
B4GALNT1Q00973 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
B4GALNT1Q00973 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
B4GALNT1Q00973 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
B4GALNT1Q00973 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
B4GALNT1Q00973 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
B4GALNT1Q00973 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
B4GALNT1Q00973 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
B4GALNT1Q00973 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
B4GALNT1Q00973 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
B4GALNT1Q00973 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
B4GALNT1Q00973 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
B4GALNT1Q00973 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
B4GALNT1Q00973 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
B4GALNT1Q00973 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
B4GALNT1Q00973 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
B4GALNT1Q00973 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
B4GALNT1Q00973 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
B4GALNT1Q00973 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
B4GALNT1Q00973 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
B4GALNT1Q00973 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
B4GALNT1Q00973 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
B4GALNT1Q00973 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
B4GALNT1Q00973 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
B4GALNT1Q00973 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
B4GALNT1Q00973 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
B4GALNT1Q00973 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
B4GALNT1Q00973 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
B4GALNT1Q00973 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
B4GALNT1Q00973 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
B4GALNT1Q00973 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
B4GALNT1Q00973 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
B4GALNT1Q00973 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
B4GALNT1Q00973 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
B4GALNT1Q00973 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
B4GALNT1Q00973 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
B4GALNT1Q00973 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
B4GALNT1Q00973 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
B4GALNT1Q00973 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
B4GALNT1Q00973 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
B4GALNT1Q00973 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
B4GALNT1Q00973 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms