Protein–RNA interactions for Protein: Q00887

PSG9, Pregnancy-specific beta-1-glycoprotein 9, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSG9Q00887 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PSG9Q00887 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSG9Q00887 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSG9Q00887 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSG9Q00887 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PSG9Q00887 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PSG9Q00887 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PSG9Q00887 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PSG9Q00887 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PSG9Q00887 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PSG9Q00887 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PSG9Q00887 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PSG9Q00887 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PSG9Q00887 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PSG9Q00887 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PSG9Q00887 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PSG9Q00887 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PSG9Q00887 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PSG9Q00887 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSG9Q00887 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSG9Q00887 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSG9Q00887 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSG9Q00887 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSG9Q00887 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSG9Q00887 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSG9Q00887 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSG9Q00887 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSG9Q00887 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSG9Q00887 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSG9Q00887 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSG9Q00887 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSG9Q00887 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSG9Q00887 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSG9Q00887 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSG9Q00887 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSG9Q00887 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSG9Q00887 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSG9Q00887 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSG9Q00887 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSG9Q00887 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSG9Q00887 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSG9Q00887 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSG9Q00887 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSG9Q00887 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSG9Q00887 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PSG9Q00887 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSG9Q00887 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSG9Q00887 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSG9Q00887 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSG9Q00887 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSG9Q00887 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSG9Q00887 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSG9Q00887 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSG9Q00887 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSG9Q00887 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSG9Q00887 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSG9Q00887 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSG9Q00887 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSG9Q00887 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSG9Q00887 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSG9Q00887 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PSG9Q00887 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSG9Q00887 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PSG9Q00887 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSG9Q00887 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSG9Q00887 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSG9Q00887 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSG9Q00887 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSG9Q00887 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSG9Q00887 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSG9Q00887 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSG9Q00887 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSG9Q00887 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSG9Q00887 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSG9Q00887 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSG9Q00887 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSG9Q00887 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSG9Q00887 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSG9Q00887 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSG9Q00887 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSG9Q00887 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSG9Q00887 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSG9Q00887 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSG9Q00887 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSG9Q00887 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSG9Q00887 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSG9Q00887 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSG9Q00887 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSG9Q00887 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSG9Q00887 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSG9Q00887 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSG9Q00887 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSG9Q00887 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSG9Q00887 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSG9Q00887 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSG9Q00887 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSG9Q00887 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSG9Q00887 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSG9Q00887 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSG9Q00887 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms