Protein–RNA interactions for Protein: Q00537

CDK17, Cyclin-dependent kinase 17, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK17Q00537 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDK17Q00537 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDK17Q00537 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDK17Q00537 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDK17Q00537 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDK17Q00537 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDK17Q00537 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDK17Q00537 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDK17Q00537 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDK17Q00537 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDK17Q00537 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDK17Q00537 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDK17Q00537 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDK17Q00537 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDK17Q00537 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDK17Q00537 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CDK17Q00537 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDK17Q00537 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDK17Q00537 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDK17Q00537 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CDK17Q00537 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDK17Q00537 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDK17Q00537 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDK17Q00537 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDK17Q00537 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDK17Q00537 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDK17Q00537 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDK17Q00537 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDK17Q00537 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDK17Q00537 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDK17Q00537 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDK17Q00537 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CDK17Q00537 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDK17Q00537 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDK17Q00537 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDK17Q00537 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDK17Q00537 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDK17Q00537 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDK17Q00537 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDK17Q00537 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDK17Q00537 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDK17Q00537 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDK17Q00537 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDK17Q00537 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDK17Q00537 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDK17Q00537 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDK17Q00537 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CDK17Q00537 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDK17Q00537 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CDK17Q00537 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDK17Q00537 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDK17Q00537 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDK17Q00537 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDK17Q00537 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDK17Q00537 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDK17Q00537 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDK17Q00537 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDK17Q00537 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDK17Q00537 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDK17Q00537 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDK17Q00537 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDK17Q00537 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDK17Q00537 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDK17Q00537 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDK17Q00537 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDK17Q00537 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDK17Q00537 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDK17Q00537 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDK17Q00537 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDK17Q00537 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDK17Q00537 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDK17Q00537 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDK17Q00537 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDK17Q00537 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CDK17Q00537 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDK17Q00537 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDK17Q00537 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDK17Q00537 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDK17Q00537 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDK17Q00537 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDK17Q00537 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDK17Q00537 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDK17Q00537 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDK17Q00537 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDK17Q00537 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDK17Q00537 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDK17Q00537 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDK17Q00537 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDK17Q00537 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDK17Q00537 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDK17Q00537 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CDK17Q00537 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDK17Q00537 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDK17Q00537 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDK17Q00537 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDK17Q00537 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDK17Q00537 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDK17Q00537 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDK17Q00537 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDK17Q00537 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms