Protein–RNA interactions for Protein: P98155

VLDLR, Very low-density lipoprotein receptor, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VLDLRP98155 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
VLDLRP98155 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
VLDLRP98155 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
VLDLRP98155 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
VLDLRP98155 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
VLDLRP98155 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
VLDLRP98155 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
VLDLRP98155 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
VLDLRP98155 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
VLDLRP98155 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
VLDLRP98155 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
VLDLRP98155 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
VLDLRP98155 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
VLDLRP98155 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
VLDLRP98155 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
VLDLRP98155 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
VLDLRP98155 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
VLDLRP98155 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
VLDLRP98155 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
VLDLRP98155 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
VLDLRP98155 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
VLDLRP98155 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
VLDLRP98155 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
VLDLRP98155 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
VLDLRP98155 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
VLDLRP98155 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
VLDLRP98155 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
VLDLRP98155 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
VLDLRP98155 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
VLDLRP98155 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
VLDLRP98155 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
VLDLRP98155 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
VLDLRP98155 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
VLDLRP98155 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
VLDLRP98155 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
VLDLRP98155 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
VLDLRP98155 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
VLDLRP98155 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
VLDLRP98155 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
VLDLRP98155 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
VLDLRP98155 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
VLDLRP98155 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
VLDLRP98155 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
VLDLRP98155 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
VLDLRP98155 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
VLDLRP98155 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
VLDLRP98155 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
VLDLRP98155 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
VLDLRP98155 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
VLDLRP98155 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
VLDLRP98155 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
VLDLRP98155 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
VLDLRP98155 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VLDLRP98155 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VLDLRP98155 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
VLDLRP98155 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VLDLRP98155 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VLDLRP98155 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VLDLRP98155 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VLDLRP98155 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VLDLRP98155 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
VLDLRP98155 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
VLDLRP98155 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
VLDLRP98155 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
VLDLRP98155 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
VLDLRP98155 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
VLDLRP98155 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
VLDLRP98155 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
VLDLRP98155 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
VLDLRP98155 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
VLDLRP98155 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
VLDLRP98155 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
VLDLRP98155 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
VLDLRP98155 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
VLDLRP98155 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
VLDLRP98155 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
VLDLRP98155 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
VLDLRP98155 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
VLDLRP98155 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
VLDLRP98155 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
VLDLRP98155 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
VLDLRP98155 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
VLDLRP98155 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
VLDLRP98155 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
VLDLRP98155 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
VLDLRP98155 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
VLDLRP98155 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
VLDLRP98155 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
VLDLRP98155 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
VLDLRP98155 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
VLDLRP98155 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
VLDLRP98155 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
VLDLRP98155 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
VLDLRP98155 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
VLDLRP98155 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
VLDLRP98155 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
VLDLRP98155 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
VLDLRP98155 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
VLDLRP98155 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
VLDLRP98155 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms