Protein–RNA interactions for Protein: P80723

BASP1, Brain acid soluble protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BASP1P80723 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BASP1P80723 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BASP1P80723 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
BASP1P80723 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BASP1P80723 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BASP1P80723 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BASP1P80723 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BASP1P80723 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BASP1P80723 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BASP1P80723 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BASP1P80723 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
BASP1P80723 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BASP1P80723 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BASP1P80723 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BASP1P80723 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BASP1P80723 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BASP1P80723 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BASP1P80723 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
BASP1P80723 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BASP1P80723 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BASP1P80723 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BASP1P80723 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BASP1P80723 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BASP1P80723 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BASP1P80723 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BASP1P80723 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BASP1P80723 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BASP1P80723 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BASP1P80723 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BASP1P80723 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BASP1P80723 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BASP1P80723 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BASP1P80723 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BASP1P80723 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BASP1P80723 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BASP1P80723 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BASP1P80723 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BASP1P80723 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BASP1P80723 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BASP1P80723 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
BASP1P80723 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BASP1P80723 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BASP1P80723 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BASP1P80723 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BASP1P80723 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BASP1P80723 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BASP1P80723 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
BASP1P80723 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
BASP1P80723 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BASP1P80723 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BASP1P80723 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BASP1P80723 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BASP1P80723 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BASP1P80723 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BASP1P80723 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
BASP1P80723 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BASP1P80723 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BASP1P80723 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BASP1P80723 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
BASP1P80723 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
BASP1P80723 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BASP1P80723 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
BASP1P80723 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BASP1P80723 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
BASP1P80723 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BASP1P80723 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
BASP1P80723 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BASP1P80723 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
BASP1P80723 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
BASP1P80723 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BASP1P80723 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BASP1P80723 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BASP1P80723 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BASP1P80723 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BASP1P80723 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BASP1P80723 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BASP1P80723 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BASP1P80723 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
BASP1P80723 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BASP1P80723 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BASP1P80723 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BASP1P80723 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BASP1P80723 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BASP1P80723 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BASP1P80723 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BASP1P80723 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BASP1P80723 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BASP1P80723 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BASP1P80723 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BASP1P80723 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BASP1P80723 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BASP1P80723 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BASP1P80723 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BASP1P80723 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BASP1P80723 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BASP1P80723 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BASP1P80723 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BASP1P80723 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BASP1P80723 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BASP1P80723 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms