Protein–RNA interactions for Protein: P78333

GPC5, Glypican-5, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC5P78333 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GPC5P78333 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GPC5P78333 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
GPC5P78333 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GPC5P78333 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GPC5P78333 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GPC5P78333 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GPC5P78333 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GPC5P78333 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
GPC5P78333 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GPC5P78333 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GPC5P78333 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
GPC5P78333 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
GPC5P78333 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GPC5P78333 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
GPC5P78333 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GPC5P78333 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GPC5P78333 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GPC5P78333 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPC5P78333 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPC5P78333 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPC5P78333 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPC5P78333 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPC5P78333 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPC5P78333 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
GPC5P78333 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
GPC5P78333 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPC5P78333 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPC5P78333 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPC5P78333 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPC5P78333 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPC5P78333 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPC5P78333 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPC5P78333 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPC5P78333 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPC5P78333 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPC5P78333 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPC5P78333 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPC5P78333 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPC5P78333 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPC5P78333 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPC5P78333 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPC5P78333 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPC5P78333 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GPC5P78333 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GPC5P78333 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
GPC5P78333 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GPC5P78333 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GPC5P78333 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GPC5P78333 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GPC5P78333 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GPC5P78333 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPC5P78333 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPC5P78333 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPC5P78333 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPC5P78333 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
GPC5P78333 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPC5P78333 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPC5P78333 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPC5P78333 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPC5P78333 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPC5P78333 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPC5P78333 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPC5P78333 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPC5P78333 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPC5P78333 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPC5P78333 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPC5P78333 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPC5P78333 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPC5P78333 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPC5P78333 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPC5P78333 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPC5P78333 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPC5P78333 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPC5P78333 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPC5P78333 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPC5P78333 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPC5P78333 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPC5P78333 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
GPC5P78333 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GPC5P78333 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
GPC5P78333 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GPC5P78333 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GPC5P78333 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
GPC5P78333 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
GPC5P78333 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
GPC5P78333 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
GPC5P78333 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
GPC5P78333 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GPC5P78333 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GPC5P78333 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPC5P78333 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPC5P78333 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPC5P78333 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
GPC5P78333 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPC5P78333 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPC5P78333 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPC5P78333 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPC5P78333 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPC5P78333 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms