Protein–RNA interactions for Protein: P63173

RPL38, 60S ribosomal protein L38, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 70 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL38P63173 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPL38P63173 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPL38P63173 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPL38P63173 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPL38P63173 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPL38P63173 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPL38P63173 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPL38P63173 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPL38P63173 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPL38P63173 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPL38P63173 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPL38P63173 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPL38P63173 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPL38P63173 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPL38P63173 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPL38P63173 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPL38P63173 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPL38P63173 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPL38P63173 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPL38P63173 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPL38P63173 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPL38P63173 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPL38P63173 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPL38P63173 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPL38P63173 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPL38P63173 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPL38P63173 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPL38P63173 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPL38P63173 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPL38P63173 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPL38P63173 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPL38P63173 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPL38P63173 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RPL38P63173 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPL38P63173 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPL38P63173 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPL38P63173 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPL38P63173 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPL38P63173 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPL38P63173 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPL38P63173 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPL38P63173 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPL38P63173 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPL38P63173 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPL38P63173 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPL38P63173 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPL38P63173 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPL38P63173 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPL38P63173 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPL38P63173 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPL38P63173 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPL38P63173 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPL38P63173 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPL38P63173 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPL38P63173 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPL38P63173 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RPL38P63173 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPL38P63173 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPL38P63173 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPL38P63173 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPL38P63173 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPL38P63173 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPL38P63173 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPL38P63173 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPL38P63173 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPL38P63173 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPL38P63173 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPL38P63173 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPL38P63173 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPL38P63173 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPL38P63173 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPL38P63173 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPL38P63173 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPL38P63173 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPL38P63173 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPL38P63173 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPL38P63173 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPL38P63173 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPL38P63173 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPL38P63173 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPL38P63173 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPL38P63173 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPL38P63173 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPL38P63173 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
RPL38P63173 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPL38P63173 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPL38P63173 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPL38P63173 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPL38P63173 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPL38P63173 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPL38P63173 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPL38P63173 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPL38P63173 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPL38P63173 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPL38P63173 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPL38P63173 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPL38P63173 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPL38P63173 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPL38P63173 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPL38P63173 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms