Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MCCD1P59942 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MCCD1P59942 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MCCD1P59942 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MCCD1P59942 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MCCD1P59942 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MCCD1P59942 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MCCD1P59942 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MCCD1P59942 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MCCD1P59942 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MCCD1P59942 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MCCD1P59942 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MCCD1P59942 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MCCD1P59942 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MCCD1P59942 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MCCD1P59942 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
MCCD1P59942 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
MCCD1P59942 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MCCD1P59942 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MCCD1P59942 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MCCD1P59942 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MCCD1P59942 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MCCD1P59942 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MCCD1P59942 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MCCD1P59942 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MCCD1P59942 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MCCD1P59942 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MCCD1P59942 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MCCD1P59942 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MCCD1P59942 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MCCD1P59942 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MCCD1P59942 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MCCD1P59942 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MCCD1P59942 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MCCD1P59942 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MCCD1P59942 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MCCD1P59942 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MCCD1P59942 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MCCD1P59942 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCCD1P59942 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCCD1P59942 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCCD1P59942 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
MCCD1P59942 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCCD1P59942 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCCD1P59942 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCCD1P59942 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCCD1P59942 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCCD1P59942 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
MCCD1P59942 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCCD1P59942 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCCD1P59942 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCCD1P59942 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCCD1P59942 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCCD1P59942 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCCD1P59942 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCCD1P59942 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCCD1P59942 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCCD1P59942 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MCCD1P59942 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MCCD1P59942 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MCCD1P59942 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MCCD1P59942 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MCCD1P59942 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MCCD1P59942 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MCCD1P59942 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MCCD1P59942 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MCCD1P59942 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MCCD1P59942 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MCCD1P59942 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
MCCD1P59942 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MCCD1P59942 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MCCD1P59942 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
MCCD1P59942 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
MCCD1P59942 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MCCD1P59942 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MCCD1P59942 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MCCD1P59942 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
MCCD1P59942 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MCCD1P59942 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MCCD1P59942 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MCCD1P59942 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MCCD1P59942 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MCCD1P59942 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MCCD1P59942 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MCCD1P59942 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
MCCD1P59942 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MCCD1P59942 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MCCD1P59942 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MCCD1P59942 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MCCD1P59942 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MCCD1P59942 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MCCD1P59942 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MCCD1P59942 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MCCD1P59942 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MCCD1P59942 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MCCD1P59942 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MCCD1P59942 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MCCD1P59942 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MCCD1P59942 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MCCD1P59942 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms