Protein–RNA interactions for Protein: P58546

MTPN, Myotrophin, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTPNP58546 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MTPNP58546 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MTPNP58546 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MTPNP58546 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MTPNP58546 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MTPNP58546 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MTPNP58546 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.31■■□□□ 1
MTPNP58546 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MTPNP58546 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MTPNP58546 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MTPNP58546 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MTPNP58546 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MTPNP58546 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
MTPNP58546 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MTPNP58546 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MTPNP58546 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.3■■□□□ 1
MTPNP58546 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MTPNP58546 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MTPNP58546 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MTPNP58546 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MTPNP58546 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MTPNP58546 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MTPNP58546 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MTPNP58546 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MTPNP58546 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MTPNP58546 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MTPNP58546 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MTPNP58546 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MTPNP58546 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
MTPNP58546 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MTPNP58546 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MTPNP58546 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MTPNP58546 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MTPNP58546 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MTPNP58546 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MTPNP58546 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MTPNP58546 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MTPNP58546 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MTPNP58546 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MTPNP58546 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MTPNP58546 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MTPNP58546 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MTPNP58546 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MTPNP58546 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.27■■□□□ 1
MTPNP58546 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
MTPNP58546 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
MTPNP58546 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
MTPNP58546 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTPNP58546 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTPNP58546 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTPNP58546 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTPNP58546 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTPNP58546 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTPNP58546 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTPNP58546 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTPNP58546 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
MTPNP58546 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTPNP58546 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTPNP58546 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTPNP58546 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTPNP58546 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTPNP58546 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MTPNP58546 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MTPNP58546 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MTPNP58546 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MTPNP58546 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MTPNP58546 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MTPNP58546 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MTPNP58546 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MTPNP58546 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MTPNP58546 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MTPNP58546 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MTPNP58546 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
MTPNP58546 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MTPNP58546 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MTPNP58546 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MTPNP58546 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MTPNP58546 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MTPNP58546 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MTPNP58546 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MTPNP58546 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MTPNP58546 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MTPNP58546 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MTPNP58546 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MTPNP58546 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MTPNP58546 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
MTPNP58546 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MTPNP58546 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MTPNP58546 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MTPNP58546 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MTPNP58546 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MTPNP58546 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MTPNP58546 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MTPNP58546 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MTPNP58546 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MTPNP58546 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MTPNP58546 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MTPNP58546 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MTPNP58546 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MTPNP58546 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms