Protein–RNA interactions for Protein: P57735

RAB25, Ras-related protein Rab-25, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB25P57735 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB25P57735 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB25P57735 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB25P57735 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB25P57735 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB25P57735 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB25P57735 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB25P57735 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB25P57735 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB25P57735 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB25P57735 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB25P57735 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB25P57735 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB25P57735 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB25P57735 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB25P57735 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB25P57735 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB25P57735 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB25P57735 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB25P57735 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB25P57735 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB25P57735 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB25P57735 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB25P57735 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB25P57735 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB25P57735 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB25P57735 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB25P57735 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB25P57735 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB25P57735 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB25P57735 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB25P57735 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB25P57735 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB25P57735 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB25P57735 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB25P57735 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB25P57735 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB25P57735 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB25P57735 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB25P57735 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB25P57735 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAB25P57735 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAB25P57735 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAB25P57735 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAB25P57735 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAB25P57735 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAB25P57735 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAB25P57735 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
RAB25P57735 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAB25P57735 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAB25P57735 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAB25P57735 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAB25P57735 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAB25P57735 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAB25P57735 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAB25P57735 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAB25P57735 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAB25P57735 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAB25P57735 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAB25P57735 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAB25P57735 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAB25P57735 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAB25P57735 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAB25P57735 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAB25P57735 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAB25P57735 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
RAB25P57735 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
RAB25P57735 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
RAB25P57735 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
RAB25P57735 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
RAB25P57735 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB25P57735 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB25P57735 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB25P57735 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB25P57735 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB25P57735 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB25P57735 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB25P57735 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB25P57735 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB25P57735 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB25P57735 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB25P57735 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB25P57735 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB25P57735 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB25P57735 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB25P57735 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB25P57735 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB25P57735 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB25P57735 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB25P57735 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB25P57735 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB25P57735 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB25P57735 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB25P57735 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB25P57735 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB25P57735 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB25P57735 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB25P57735 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB25P57735 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB25P57735 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms