Protein–RNA interactions for Protein: P57060

RWDD2B, RWD domain-containing protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RWDD2BP57060 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RWDD2BP57060 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RWDD2BP57060 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RWDD2BP57060 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RWDD2BP57060 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RWDD2BP57060 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RWDD2BP57060 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RWDD2BP57060 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RWDD2BP57060 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RWDD2BP57060 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RWDD2BP57060 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RWDD2BP57060 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RWDD2BP57060 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RWDD2BP57060 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RWDD2BP57060 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RWDD2BP57060 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RWDD2BP57060 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RWDD2BP57060 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RWDD2BP57060 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RWDD2BP57060 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RWDD2BP57060 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RWDD2BP57060 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RWDD2BP57060 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RWDD2BP57060 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RWDD2BP57060 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RWDD2BP57060 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RWDD2BP57060 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RWDD2BP57060 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RWDD2BP57060 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RWDD2BP57060 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RWDD2BP57060 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RWDD2BP57060 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RWDD2BP57060 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RWDD2BP57060 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RWDD2BP57060 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RWDD2BP57060 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RWDD2BP57060 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RWDD2BP57060 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RWDD2BP57060 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RWDD2BP57060 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RWDD2BP57060 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RWDD2BP57060 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RWDD2BP57060 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RWDD2BP57060 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RWDD2BP57060 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RWDD2BP57060 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RWDD2BP57060 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RWDD2BP57060 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RWDD2BP57060 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RWDD2BP57060 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RWDD2BP57060 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RWDD2BP57060 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RWDD2BP57060 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RWDD2BP57060 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RWDD2BP57060 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RWDD2BP57060 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RWDD2BP57060 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RWDD2BP57060 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RWDD2BP57060 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RWDD2BP57060 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RWDD2BP57060 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RWDD2BP57060 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RWDD2BP57060 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RWDD2BP57060 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RWDD2BP57060 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RWDD2BP57060 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RWDD2BP57060 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RWDD2BP57060 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RWDD2BP57060 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RWDD2BP57060 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RWDD2BP57060 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RWDD2BP57060 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RWDD2BP57060 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RWDD2BP57060 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RWDD2BP57060 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RWDD2BP57060 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RWDD2BP57060 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RWDD2BP57060 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RWDD2BP57060 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RWDD2BP57060 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RWDD2BP57060 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RWDD2BP57060 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RWDD2BP57060 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RWDD2BP57060 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RWDD2BP57060 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RWDD2BP57060 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RWDD2BP57060 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RWDD2BP57060 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RWDD2BP57060 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RWDD2BP57060 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RWDD2BP57060 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RWDD2BP57060 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RWDD2BP57060 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RWDD2BP57060 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RWDD2BP57060 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RWDD2BP57060 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RWDD2BP57060 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RWDD2BP57060 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RWDD2BP57060 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RWDD2BP57060 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms