Protein–RNA interactions for Protein: P55286

CDH8, Cadherin-8, humanhuman

Predictions only

Length 799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH8P55286 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDH8P55286 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDH8P55286 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDH8P55286 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDH8P55286 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDH8P55286 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDH8P55286 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDH8P55286 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDH8P55286 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDH8P55286 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CDH8P55286 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDH8P55286 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDH8P55286 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDH8P55286 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDH8P55286 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDH8P55286 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDH8P55286 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDH8P55286 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDH8P55286 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDH8P55286 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDH8P55286 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDH8P55286 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDH8P55286 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDH8P55286 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDH8P55286 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDH8P55286 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDH8P55286 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDH8P55286 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDH8P55286 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDH8P55286 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDH8P55286 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDH8P55286 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDH8P55286 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDH8P55286 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDH8P55286 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDH8P55286 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDH8P55286 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CDH8P55286 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDH8P55286 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDH8P55286 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CDH8P55286 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDH8P55286 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDH8P55286 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDH8P55286 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDH8P55286 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDH8P55286 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDH8P55286 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDH8P55286 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDH8P55286 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDH8P55286 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDH8P55286 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDH8P55286 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CDH8P55286 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CDH8P55286 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDH8P55286 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDH8P55286 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDH8P55286 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDH8P55286 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDH8P55286 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDH8P55286 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDH8P55286 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDH8P55286 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDH8P55286 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CDH8P55286 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CDH8P55286 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CDH8P55286 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDH8P55286 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDH8P55286 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDH8P55286 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDH8P55286 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDH8P55286 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDH8P55286 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDH8P55286 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDH8P55286 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDH8P55286 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDH8P55286 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDH8P55286 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDH8P55286 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDH8P55286 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDH8P55286 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDH8P55286 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDH8P55286 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDH8P55286 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDH8P55286 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CDH8P55286 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDH8P55286 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDH8P55286 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDH8P55286 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDH8P55286 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDH8P55286 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDH8P55286 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDH8P55286 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CDH8P55286 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDH8P55286 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDH8P55286 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDH8P55286 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDH8P55286 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDH8P55286 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDH8P55286 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDH8P55286 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms