Protein–RNA interactions for Protein: P55160

NCKAP1L, Nck-associated protein 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCKAP1LP55160 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NCKAP1LP55160 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NCKAP1LP55160 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NCKAP1LP55160 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NCKAP1LP55160 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NCKAP1LP55160 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NCKAP1LP55160 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NCKAP1LP55160 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NCKAP1LP55160 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NCKAP1LP55160 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NCKAP1LP55160 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NCKAP1LP55160 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NCKAP1LP55160 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NCKAP1LP55160 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NCKAP1LP55160 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NCKAP1LP55160 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NCKAP1LP55160 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NCKAP1LP55160 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NCKAP1LP55160 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NCKAP1LP55160 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NCKAP1LP55160 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NCKAP1LP55160 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NCKAP1LP55160 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NCKAP1LP55160 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NCKAP1LP55160 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NCKAP1LP55160 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NCKAP1LP55160 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NCKAP1LP55160 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NCKAP1LP55160 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NCKAP1LP55160 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NCKAP1LP55160 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NCKAP1LP55160 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NCKAP1LP55160 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NCKAP1LP55160 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NCKAP1LP55160 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NCKAP1LP55160 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NCKAP1LP55160 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NCKAP1LP55160 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NCKAP1LP55160 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NCKAP1LP55160 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NCKAP1LP55160 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NCKAP1LP55160 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NCKAP1LP55160 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NCKAP1LP55160 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NCKAP1LP55160 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NCKAP1LP55160 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
NCKAP1LP55160 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NCKAP1LP55160 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NCKAP1LP55160 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NCKAP1LP55160 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NCKAP1LP55160 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NCKAP1LP55160 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NCKAP1LP55160 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NCKAP1LP55160 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NCKAP1LP55160 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NCKAP1LP55160 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NCKAP1LP55160 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NCKAP1LP55160 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NCKAP1LP55160 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NCKAP1LP55160 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NCKAP1LP55160 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NCKAP1LP55160 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NCKAP1LP55160 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NCKAP1LP55160 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NCKAP1LP55160 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NCKAP1LP55160 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NCKAP1LP55160 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NCKAP1LP55160 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NCKAP1LP55160 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NCKAP1LP55160 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NCKAP1LP55160 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NCKAP1LP55160 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NCKAP1LP55160 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NCKAP1LP55160 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NCKAP1LP55160 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NCKAP1LP55160 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NCKAP1LP55160 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NCKAP1LP55160 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
NCKAP1LP55160 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
NCKAP1LP55160 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NCKAP1LP55160 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NCKAP1LP55160 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NCKAP1LP55160 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NCKAP1LP55160 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NCKAP1LP55160 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NCKAP1LP55160 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NCKAP1LP55160 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NCKAP1LP55160 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NCKAP1LP55160 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NCKAP1LP55160 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NCKAP1LP55160 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NCKAP1LP55160 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NCKAP1LP55160 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NCKAP1LP55160 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NCKAP1LP55160 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NCKAP1LP55160 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NCKAP1LP55160 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NCKAP1LP55160 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NCKAP1LP55160 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NCKAP1LP55160 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms