Protein–RNA interactions for Protein: P54845

NRL, Neural retina-specific leucine zipper protein, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRLP54845 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NRLP54845 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NRLP54845 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NRLP54845 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NRLP54845 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NRLP54845 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NRLP54845 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NRLP54845 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NRLP54845 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
NRLP54845 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
NRLP54845 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NRLP54845 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NRLP54845 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NRLP54845 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NRLP54845 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NRLP54845 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NRLP54845 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NRLP54845 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NRLP54845 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NRLP54845 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NRLP54845 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NRLP54845 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
NRLP54845 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
NRLP54845 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
NRLP54845 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NRLP54845 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NRLP54845 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NRLP54845 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NRLP54845 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NRLP54845 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NRLP54845 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NRLP54845 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NRLP54845 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NRLP54845 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NRLP54845 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NRLP54845 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NRLP54845 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NRLP54845 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NRLP54845 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NRLP54845 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NRLP54845 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NRLP54845 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NRLP54845 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NRLP54845 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NRLP54845 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NRLP54845 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NRLP54845 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NRLP54845 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NRLP54845 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NRLP54845 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NRLP54845 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NRLP54845 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NRLP54845 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NRLP54845 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NRLP54845 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
NRLP54845 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NRLP54845 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NRLP54845 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
NRLP54845 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NRLP54845 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NRLP54845 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NRLP54845 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NRLP54845 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NRLP54845 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NRLP54845 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NRLP54845 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NRLP54845 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NRLP54845 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NRLP54845 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NRLP54845 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NRLP54845 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NRLP54845 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NRLP54845 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NRLP54845 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NRLP54845 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NRLP54845 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NRLP54845 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NRLP54845 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NRLP54845 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NRLP54845 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NRLP54845 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NRLP54845 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NRLP54845 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NRLP54845 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NRLP54845 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NRLP54845 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NRLP54845 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NRLP54845 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NRLP54845 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NRLP54845 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
NRLP54845 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NRLP54845 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NRLP54845 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NRLP54845 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NRLP54845 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NRLP54845 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NRLP54845 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NRLP54845 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NRLP54845 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NRLP54845 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms