Protein–RNA interactions for Protein: P54107

CRISP1, Cysteine-rich secretory protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRISP1P54107 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CRISP1P54107 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CRISP1P54107 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CRISP1P54107 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CRISP1P54107 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CRISP1P54107 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CRISP1P54107 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CRISP1P54107 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CRISP1P54107 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CRISP1P54107 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CRISP1P54107 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CRISP1P54107 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CRISP1P54107 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CRISP1P54107 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CRISP1P54107 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CRISP1P54107 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CRISP1P54107 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CRISP1P54107 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CRISP1P54107 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CRISP1P54107 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CRISP1P54107 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CRISP1P54107 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CRISP1P54107 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CRISP1P54107 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CRISP1P54107 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CRISP1P54107 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CRISP1P54107 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CRISP1P54107 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CRISP1P54107 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CRISP1P54107 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CRISP1P54107 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CRISP1P54107 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CRISP1P54107 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CRISP1P54107 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CRISP1P54107 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CRISP1P54107 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CRISP1P54107 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CRISP1P54107 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CRISP1P54107 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CRISP1P54107 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CRISP1P54107 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CRISP1P54107 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CRISP1P54107 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CRISP1P54107 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CRISP1P54107 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CRISP1P54107 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CRISP1P54107 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CRISP1P54107 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CRISP1P54107 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CRISP1P54107 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CRISP1P54107 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CRISP1P54107 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CRISP1P54107 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CRISP1P54107 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CRISP1P54107 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CRISP1P54107 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CRISP1P54107 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CRISP1P54107 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CRISP1P54107 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CRISP1P54107 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CRISP1P54107 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CRISP1P54107 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CRISP1P54107 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CRISP1P54107 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CRISP1P54107 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CRISP1P54107 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CRISP1P54107 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CRISP1P54107 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CRISP1P54107 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CRISP1P54107 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CRISP1P54107 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CRISP1P54107 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CRISP1P54107 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CRISP1P54107 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CRISP1P54107 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CRISP1P54107 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CRISP1P54107 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CRISP1P54107 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CRISP1P54107 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CRISP1P54107 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CRISP1P54107 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CRISP1P54107 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CRISP1P54107 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CRISP1P54107 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CRISP1P54107 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CRISP1P54107 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CRISP1P54107 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CRISP1P54107 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CRISP1P54107 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CRISP1P54107 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CRISP1P54107 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CRISP1P54107 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CRISP1P54107 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CRISP1P54107 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CRISP1P54107 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CRISP1P54107 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CRISP1P54107 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CRISP1P54107 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CRISP1P54107 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CRISP1P54107 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms