Protein–RNA interactions for Protein: P51957

NEK4, Serine/threonine-protein kinase Nek4, humanhuman

Predictions only

Length 841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK4P51957 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NEK4P51957 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
NEK4P51957 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NEK4P51957 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NEK4P51957 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NEK4P51957 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NEK4P51957 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NEK4P51957 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NEK4P51957 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NEK4P51957 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NEK4P51957 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NEK4P51957 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NEK4P51957 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NEK4P51957 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NEK4P51957 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NEK4P51957 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NEK4P51957 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NEK4P51957 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NEK4P51957 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NEK4P51957 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NEK4P51957 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NEK4P51957 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NEK4P51957 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NEK4P51957 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NEK4P51957 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NEK4P51957 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NEK4P51957 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NEK4P51957 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NEK4P51957 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NEK4P51957 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
NEK4P51957 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NEK4P51957 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NEK4P51957 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NEK4P51957 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NEK4P51957 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
NEK4P51957 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NEK4P51957 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NEK4P51957 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NEK4P51957 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NEK4P51957 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NEK4P51957 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NEK4P51957 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NEK4P51957 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NEK4P51957 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NEK4P51957 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NEK4P51957 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NEK4P51957 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NEK4P51957 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NEK4P51957 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NEK4P51957 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NEK4P51957 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NEK4P51957 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
NEK4P51957 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NEK4P51957 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NEK4P51957 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NEK4P51957 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NEK4P51957 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NEK4P51957 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NEK4P51957 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NEK4P51957 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NEK4P51957 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NEK4P51957 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NEK4P51957 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NEK4P51957 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NEK4P51957 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NEK4P51957 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NEK4P51957 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NEK4P51957 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NEK4P51957 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NEK4P51957 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NEK4P51957 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NEK4P51957 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NEK4P51957 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NEK4P51957 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NEK4P51957 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NEK4P51957 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NEK4P51957 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NEK4P51957 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NEK4P51957 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NEK4P51957 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NEK4P51957 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
NEK4P51957 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
NEK4P51957 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NEK4P51957 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
NEK4P51957 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NEK4P51957 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NEK4P51957 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
NEK4P51957 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NEK4P51957 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NEK4P51957 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NEK4P51957 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NEK4P51957 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NEK4P51957 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NEK4P51957 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
NEK4P51957 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NEK4P51957 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NEK4P51957 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NEK4P51957 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NEK4P51957 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NEK4P51957 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms