Protein–RNA interactions for Protein: P49841

GSK3B, Glycogen synthase kinase-3 beta, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3BP49841 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GSK3BP49841 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GSK3BP49841 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
GSK3BP49841 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GSK3BP49841 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GSK3BP49841 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GSK3BP49841 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GSK3BP49841 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GSK3BP49841 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GSK3BP49841 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GSK3BP49841 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GSK3BP49841 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GSK3BP49841 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GSK3BP49841 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GSK3BP49841 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GSK3BP49841 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GSK3BP49841 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GSK3BP49841 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GSK3BP49841 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GSK3BP49841 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GSK3BP49841 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GSK3BP49841 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GSK3BP49841 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GSK3BP49841 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GSK3BP49841 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GSK3BP49841 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GSK3BP49841 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GSK3BP49841 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GSK3BP49841 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GSK3BP49841 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GSK3BP49841 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GSK3BP49841 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GSK3BP49841 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GSK3BP49841 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GSK3BP49841 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
GSK3BP49841 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GSK3BP49841 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GSK3BP49841 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GSK3BP49841 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GSK3BP49841 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GSK3BP49841 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GSK3BP49841 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GSK3BP49841 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GSK3BP49841 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GSK3BP49841 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GSK3BP49841 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GSK3BP49841 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GSK3BP49841 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GSK3BP49841 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GSK3BP49841 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GSK3BP49841 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GSK3BP49841 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GSK3BP49841 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GSK3BP49841 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GSK3BP49841 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GSK3BP49841 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GSK3BP49841 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GSK3BP49841 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GSK3BP49841 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GSK3BP49841 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GSK3BP49841 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GSK3BP49841 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GSK3BP49841 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GSK3BP49841 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GSK3BP49841 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GSK3BP49841 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GSK3BP49841 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GSK3BP49841 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GSK3BP49841 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GSK3BP49841 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GSK3BP49841 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GSK3BP49841 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GSK3BP49841 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GSK3BP49841 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GSK3BP49841 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
GSK3BP49841 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GSK3BP49841 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GSK3BP49841 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GSK3BP49841 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GSK3BP49841 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
GSK3BP49841 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GSK3BP49841 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GSK3BP49841 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GSK3BP49841 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GSK3BP49841 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GSK3BP49841 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GSK3BP49841 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GSK3BP49841 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
GSK3BP49841 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GSK3BP49841 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GSK3BP49841 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GSK3BP49841 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GSK3BP49841 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GSK3BP49841 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GSK3BP49841 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GSK3BP49841 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GSK3BP49841 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GSK3BP49841 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GSK3BP49841 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GSK3BP49841 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms