Protein–RNA interactions for Protein: P46778

RPL21, 60S ribosomal protein L21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL21P46778 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPL21P46778 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPL21P46778 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPL21P46778 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPL21P46778 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RPL21P46778 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPL21P46778 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPL21P46778 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPL21P46778 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPL21P46778 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
RPL21P46778 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
RPL21P46778 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPL21P46778 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPL21P46778 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPL21P46778 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPL21P46778 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPL21P46778 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPL21P46778 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPL21P46778 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPL21P46778 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPL21P46778 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
RPL21P46778 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPL21P46778 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
RPL21P46778 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPL21P46778 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RPL21P46778 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPL21P46778 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPL21P46778 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPL21P46778 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPL21P46778 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPL21P46778 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPL21P46778 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPL21P46778 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPL21P46778 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPL21P46778 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPL21P46778 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPL21P46778 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPL21P46778 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPL21P46778 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPL21P46778 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPL21P46778 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPL21P46778 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPL21P46778 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPL21P46778 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPL21P46778 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPL21P46778 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPL21P46778 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPL21P46778 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPL21P46778 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPL21P46778 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPL21P46778 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPL21P46778 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPL21P46778 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPL21P46778 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPL21P46778 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPL21P46778 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPL21P46778 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPL21P46778 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPL21P46778 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPL21P46778 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RPL21P46778 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPL21P46778 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPL21P46778 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPL21P46778 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPL21P46778 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPL21P46778 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPL21P46778 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPL21P46778 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPL21P46778 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPL21P46778 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPL21P46778 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPL21P46778 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RPL21P46778 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RPL21P46778 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RPL21P46778 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RPL21P46778 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RPL21P46778 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPL21P46778 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPL21P46778 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPL21P46778 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPL21P46778 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPL21P46778 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPL21P46778 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
RPL21P46778 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPL21P46778 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
RPL21P46778 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPL21P46778 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPL21P46778 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPL21P46778 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPL21P46778 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPL21P46778 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPL21P46778 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPL21P46778 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPL21P46778 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPL21P46778 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPL21P46778 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPL21P46778 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPL21P46778 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPL21P46778 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPL21P46778 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms