Protein–RNA interactions for Protein: P46527

CDKN1B, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN1BP46527 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDKN1BP46527 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDKN1BP46527 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDKN1BP46527 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDKN1BP46527 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDKN1BP46527 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDKN1BP46527 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDKN1BP46527 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDKN1BP46527 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDKN1BP46527 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDKN1BP46527 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDKN1BP46527 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CDKN1BP46527 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CDKN1BP46527 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CDKN1BP46527 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CDKN1BP46527 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CDKN1BP46527 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CDKN1BP46527 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CDKN1BP46527 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CDKN1BP46527 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CDKN1BP46527 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CDKN1BP46527 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CDKN1BP46527 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDKN1BP46527 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDKN1BP46527 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDKN1BP46527 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDKN1BP46527 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDKN1BP46527 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDKN1BP46527 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDKN1BP46527 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDKN1BP46527 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDKN1BP46527 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDKN1BP46527 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDKN1BP46527 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CDKN1BP46527 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CDKN1BP46527 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CDKN1BP46527 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CDKN1BP46527 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CDKN1BP46527 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CDKN1BP46527 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CDKN1BP46527 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CDKN1BP46527 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CDKN1BP46527 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CDKN1BP46527 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CDKN1BP46527 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CDKN1BP46527 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CDKN1BP46527 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CDKN1BP46527 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CDKN1BP46527 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CDKN1BP46527 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CDKN1BP46527 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CDKN1BP46527 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDKN1BP46527 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDKN1BP46527 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDKN1BP46527 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDKN1BP46527 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDKN1BP46527 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDKN1BP46527 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDKN1BP46527 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDKN1BP46527 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDKN1BP46527 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDKN1BP46527 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDKN1BP46527 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDKN1BP46527 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDKN1BP46527 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDKN1BP46527 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDKN1BP46527 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDKN1BP46527 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDKN1BP46527 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDKN1BP46527 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDKN1BP46527 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDKN1BP46527 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDKN1BP46527 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CDKN1BP46527 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDKN1BP46527 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDKN1BP46527 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDKN1BP46527 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDKN1BP46527 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CDKN1BP46527 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDKN1BP46527 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDKN1BP46527 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDKN1BP46527 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDKN1BP46527 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDKN1BP46527 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CDKN1BP46527 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDKN1BP46527 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDKN1BP46527 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDKN1BP46527 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDKN1BP46527 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDKN1BP46527 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDKN1BP46527 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDKN1BP46527 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDKN1BP46527 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDKN1BP46527 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CDKN1BP46527 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDKN1BP46527 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDKN1BP46527 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDKN1BP46527 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDKN1BP46527 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDKN1BP46527 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms