Protein–RNA interactions for Protein: P40692

MLH1, DNA mismatch repair protein Mlh1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH1P40692 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MLH1P40692 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MLH1P40692 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MLH1P40692 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MLH1P40692 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MLH1P40692 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
MLH1P40692 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MLH1P40692 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MLH1P40692 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
MLH1P40692 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MLH1P40692 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
MLH1P40692 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MLH1P40692 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
MLH1P40692 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MLH1P40692 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MLH1P40692 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MLH1P40692 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MLH1P40692 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MLH1P40692 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MLH1P40692 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
MLH1P40692 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MLH1P40692 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MLH1P40692 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MLH1P40692 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MLH1P40692 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MLH1P40692 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MLH1P40692 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MLH1P40692 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MLH1P40692 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MLH1P40692 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MLH1P40692 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MLH1P40692 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MLH1P40692 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MLH1P40692 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MLH1P40692 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MLH1P40692 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MLH1P40692 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MLH1P40692 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MLH1P40692 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MLH1P40692 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MLH1P40692 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MLH1P40692 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MLH1P40692 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MLH1P40692 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MLH1P40692 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MLH1P40692 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MLH1P40692 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MLH1P40692 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MLH1P40692 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MLH1P40692 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MLH1P40692 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MLH1P40692 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MLH1P40692 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MLH1P40692 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MLH1P40692 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MLH1P40692 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MLH1P40692 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
MLH1P40692 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MLH1P40692 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MLH1P40692 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MLH1P40692 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MLH1P40692 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MLH1P40692 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MLH1P40692 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MLH1P40692 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MLH1P40692 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MLH1P40692 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MLH1P40692 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MLH1P40692 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MLH1P40692 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MLH1P40692 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MLH1P40692 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MLH1P40692 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MLH1P40692 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MLH1P40692 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MLH1P40692 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MLH1P40692 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MLH1P40692 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MLH1P40692 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MLH1P40692 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MLH1P40692 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MLH1P40692 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MLH1P40692 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MLH1P40692 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MLH1P40692 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MLH1P40692 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MLH1P40692 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
MLH1P40692 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MLH1P40692 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
MLH1P40692 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MLH1P40692 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MLH1P40692 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MLH1P40692 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MLH1P40692 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MLH1P40692 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MLH1P40692 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MLH1P40692 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MLH1P40692 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
MLH1P40692 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MLH1P40692 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms