Protein–RNA interactions for Protein: P38117

ETFB, Electron transfer flavoprotein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFBP38117 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ETFBP38117 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ETFBP38117 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ETFBP38117 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ETFBP38117 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ETFBP38117 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ETFBP38117 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ETFBP38117 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ETFBP38117 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ETFBP38117 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ETFBP38117 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ETFBP38117 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
ETFBP38117 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ETFBP38117 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ETFBP38117 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ETFBP38117 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ETFBP38117 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ETFBP38117 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ETFBP38117 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ETFBP38117 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ETFBP38117 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ETFBP38117 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ETFBP38117 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ETFBP38117 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ETFBP38117 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ETFBP38117 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ETFBP38117 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ETFBP38117 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ETFBP38117 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ETFBP38117 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ETFBP38117 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ETFBP38117 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ETFBP38117 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ETFBP38117 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ETFBP38117 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ETFBP38117 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ETFBP38117 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ETFBP38117 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ETFBP38117 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ETFBP38117 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ETFBP38117 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ETFBP38117 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ETFBP38117 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ETFBP38117 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ETFBP38117 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ETFBP38117 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ETFBP38117 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ETFBP38117 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ETFBP38117 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ETFBP38117 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ETFBP38117 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ETFBP38117 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ETFBP38117 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ETFBP38117 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ETFBP38117 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ETFBP38117 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ETFBP38117 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ETFBP38117 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ETFBP38117 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ETFBP38117 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ETFBP38117 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ETFBP38117 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ETFBP38117 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ETFBP38117 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ETFBP38117 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ETFBP38117 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ETFBP38117 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ETFBP38117 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ETFBP38117 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ETFBP38117 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ETFBP38117 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ETFBP38117 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ETFBP38117 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ETFBP38117 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ETFBP38117 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ETFBP38117 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ETFBP38117 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ETFBP38117 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ETFBP38117 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ETFBP38117 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ETFBP38117 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ETFBP38117 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ETFBP38117 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ETFBP38117 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ETFBP38117 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ETFBP38117 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ETFBP38117 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ETFBP38117 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
ETFBP38117 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
ETFBP38117 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ETFBP38117 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ETFBP38117 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ETFBP38117 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ETFBP38117 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ETFBP38117 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ETFBP38117 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ETFBP38117 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ETFBP38117 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ETFBP38117 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ETFBP38117 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms