Protein–RNA interactions for Protein: P35968

KDR, Vascular endothelial growth factor receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDRP35968 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
KDRP35968 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
KDRP35968 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
KDRP35968 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
KDRP35968 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
KDRP35968 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
KDRP35968 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
KDRP35968 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
KDRP35968 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
KDRP35968 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
KDRP35968 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
KDRP35968 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
KDRP35968 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
KDRP35968 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
KDRP35968 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
KDRP35968 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
KDRP35968 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
KDRP35968 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
KDRP35968 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
KDRP35968 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
KDRP35968 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
KDRP35968 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
KDRP35968 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
KDRP35968 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
KDRP35968 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
KDRP35968 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
KDRP35968 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
KDRP35968 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
KDRP35968 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
KDRP35968 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
KDRP35968 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
KDRP35968 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
KDRP35968 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
KDRP35968 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
KDRP35968 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
KDRP35968 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
KDRP35968 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
KDRP35968 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
KDRP35968 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
KDRP35968 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
KDRP35968 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
KDRP35968 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
KDRP35968 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
KDRP35968 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
KDRP35968 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
KDRP35968 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
KDRP35968 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
KDRP35968 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
KDRP35968 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
KDRP35968 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
KDRP35968 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
KDRP35968 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
KDRP35968 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
KDRP35968 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
KDRP35968 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.35
KDRP35968 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
KDRP35968 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
KDRP35968 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
KDRP35968 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
KDRP35968 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
KDRP35968 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
KDRP35968 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
KDRP35968 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
KDRP35968 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
KDRP35968 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
KDRP35968 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
KDRP35968 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
KDRP35968 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
KDRP35968 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
KDRP35968 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
KDRP35968 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
KDRP35968 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
KDRP35968 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
KDRP35968 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
KDRP35968 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
KDRP35968 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
KDRP35968 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
KDRP35968 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
KDRP35968 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
KDRP35968 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
KDRP35968 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
KDRP35968 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
KDRP35968 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
KDRP35968 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
KDRP35968 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
KDRP35968 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
KDRP35968 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
KDRP35968 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
KDRP35968 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
KDRP35968 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
KDRP35968 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
KDRP35968 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
KDRP35968 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
KDRP35968 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
KDRP35968 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
KDRP35968 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
KDRP35968 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
KDRP35968 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
KDRP35968 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
KDRP35968 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms