Protein–RNA interactions for Protein: P32246

CCR1, C-C chemokine receptor type 1, humanhuman

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR1P32246 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCR1P32246 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCR1P32246 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCR1P32246 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCR1P32246 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCR1P32246 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCR1P32246 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCR1P32246 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCR1P32246 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCR1P32246 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCR1P32246 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCR1P32246 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCR1P32246 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCR1P32246 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCR1P32246 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCR1P32246 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCR1P32246 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CCR1P32246 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CCR1P32246 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CCR1P32246 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCR1P32246 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCR1P32246 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCR1P32246 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCR1P32246 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCR1P32246 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CCR1P32246 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCR1P32246 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCR1P32246 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCR1P32246 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCR1P32246 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CCR1P32246 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCR1P32246 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCR1P32246 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCR1P32246 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCR1P32246 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCR1P32246 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCR1P32246 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCR1P32246 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCR1P32246 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCR1P32246 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCR1P32246 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCR1P32246 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCR1P32246 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCR1P32246 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCR1P32246 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CCR1P32246 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCR1P32246 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCR1P32246 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCR1P32246 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCR1P32246 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CCR1P32246 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CCR1P32246 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCR1P32246 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCR1P32246 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCR1P32246 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCR1P32246 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCR1P32246 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCR1P32246 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCR1P32246 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCR1P32246 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCR1P32246 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCR1P32246 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCR1P32246 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCR1P32246 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCR1P32246 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
CCR1P32246 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCR1P32246 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCR1P32246 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCR1P32246 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCR1P32246 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCR1P32246 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCR1P32246 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CCR1P32246 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCR1P32246 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCR1P32246 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCR1P32246 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCR1P32246 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCR1P32246 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCR1P32246 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CCR1P32246 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCR1P32246 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCR1P32246 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CCR1P32246 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCR1P32246 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCR1P32246 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCR1P32246 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCR1P32246 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCR1P32246 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCR1P32246 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCR1P32246 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCR1P32246 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCR1P32246 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CCR1P32246 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCR1P32246 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCR1P32246 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCR1P32246 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCR1P32246 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCR1P32246 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCR1P32246 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCR1P32246 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms