Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GJB2P29033 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GJB2P29033 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GJB2P29033 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
GJB2P29033 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GJB2P29033 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GJB2P29033 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GJB2P29033 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GJB2P29033 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GJB2P29033 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GJB2P29033 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GJB2P29033 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GJB2P29033 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GJB2P29033 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GJB2P29033 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GJB2P29033 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GJB2P29033 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GJB2P29033 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GJB2P29033 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
GJB2P29033 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GJB2P29033 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GJB2P29033 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GJB2P29033 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GJB2P29033 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GJB2P29033 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GJB2P29033 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GJB2P29033 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GJB2P29033 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GJB2P29033 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GJB2P29033 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GJB2P29033 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GJB2P29033 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GJB2P29033 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GJB2P29033 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GJB2P29033 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GJB2P29033 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GJB2P29033 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GJB2P29033 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GJB2P29033 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GJB2P29033 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GJB2P29033 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GJB2P29033 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GJB2P29033 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GJB2P29033 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GJB2P29033 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GJB2P29033 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GJB2P29033 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GJB2P29033 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GJB2P29033 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
GJB2P29033 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GJB2P29033 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GJB2P29033 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GJB2P29033 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GJB2P29033 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GJB2P29033 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GJB2P29033 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GJB2P29033 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GJB2P29033 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GJB2P29033 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GJB2P29033 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GJB2P29033 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GJB2P29033 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GJB2P29033 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GJB2P29033 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GJB2P29033 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GJB2P29033 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
GJB2P29033 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GJB2P29033 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GJB2P29033 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GJB2P29033 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GJB2P29033 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GJB2P29033 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GJB2P29033 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
GJB2P29033 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GJB2P29033 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GJB2P29033 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GJB2P29033 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GJB2P29033 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
GJB2P29033 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
GJB2P29033 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
GJB2P29033 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
GJB2P29033 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GJB2P29033 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GJB2P29033 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GJB2P29033 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GJB2P29033 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GJB2P29033 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GJB2P29033 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GJB2P29033 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GJB2P29033 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GJB2P29033 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GJB2P29033 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GJB2P29033 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GJB2P29033 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GJB2P29033 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GJB2P29033 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GJB2P29033 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GJB2P29033 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GJB2P29033 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GJB2P29033 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms