Protein–RNA interactions for Protein: P27797

CALR, Calreticulin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALRP27797 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CALRP27797 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CALRP27797 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CALRP27797 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CALRP27797 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CALRP27797 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CALRP27797 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CALRP27797 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CALRP27797 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CALRP27797 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CALRP27797 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CALRP27797 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CALRP27797 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CALRP27797 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CALRP27797 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CALRP27797 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CALRP27797 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CALRP27797 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CALRP27797 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CALRP27797 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CALRP27797 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CALRP27797 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CALRP27797 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CALRP27797 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CALRP27797 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CALRP27797 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CALRP27797 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CALRP27797 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CALRP27797 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CALRP27797 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CALRP27797 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CALRP27797 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CALRP27797 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CALRP27797 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CALRP27797 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CALRP27797 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CALRP27797 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CALRP27797 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CALRP27797 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CALRP27797 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CALRP27797 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CALRP27797 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CALRP27797 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CALRP27797 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CALRP27797 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CALRP27797 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CALRP27797 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CALRP27797 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CALRP27797 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CALRP27797 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CALRP27797 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CALRP27797 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CALRP27797 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CALRP27797 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CALRP27797 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CALRP27797 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CALRP27797 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CALRP27797 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CALRP27797 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CALRP27797 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CALRP27797 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CALRP27797 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CALRP27797 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CALRP27797 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CALRP27797 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CALRP27797 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CALRP27797 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CALRP27797 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CALRP27797 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CALRP27797 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CALRP27797 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CALRP27797 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CALRP27797 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CALRP27797 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CALRP27797 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CALRP27797 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CALRP27797 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CALRP27797 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CALRP27797 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CALRP27797 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CALRP27797 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CALRP27797 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CALRP27797 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CALRP27797 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CALRP27797 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CALRP27797 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CALRP27797 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CALRP27797 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CALRP27797 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CALRP27797 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CALRP27797 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CALRP27797 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
CALRP27797 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
CALRP27797 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CALRP27797 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CALRP27797 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CALRP27797 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CALRP27797 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CALRP27797 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CALRP27797 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms