Protein–RNA interactions for Protein: P26196

DDX6, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX6, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX6P26196 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.035e-7■■■■■ 30
DDX6P26196 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.045e-7■■■■■ 30
DDX6P26196 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.055e-7■■■■■ 30
DDX6P26196 FGFR1-228ENST00000526688 570 ntTSL 314.55□□□□□ -0.085e-7■■■■■ 30
DDX6P26196 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.17e-12■■■■■ 30
DDX6P26196 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.155e-7■■■■■ 30
DDX6P26196 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.185e-7■■■■■ 30
DDX6P26196 HS3ST3B1-202ENST00000466596 2808 ntTSL 213.82□□□□□ -0.25e-7■■■■■ 30
DDX6P26196 SMYD3-207ENST00000462422 971 ntTSL 513.73□□□□□ -0.215e-7■■■■■ 30
DDX6P26196 ZNF318-202ENST00000605935 3836 ntTSL 1 (best)13.71□□□□□ -0.215e-7■■■■■ 30
DDX6P26196 CDC42-202ENST00000344548 2256 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.232e-18■■■■■ 30
DDX6P26196 MFSD5-205ENST00000552097 427 ntTSL 313.38□□□□□ -0.275e-7■■■■■ 30
DDX6P26196 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.297e-12■■■■■ 30
DDX6P26196 MYH9-205ENST00000463027 562 ntTSL 313.06□□□□□ -0.325e-7■■■■■ 30
DDX6P26196 KANSL1-220ENST00000638551 899 ntTSL 513.04□□□□□ -0.325e-7■■■■■ 30
DDX6P26196 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.355e-7■■■■■ 30
DDX6P26196 HSPH1-206ENST00000602786 3488 ntTSL 1 (best)12.8□□□□□ -0.365e-7■■■■■ 30
DDX6P26196 ZNF318-201ENST00000361428 8006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.395e-7■■■■■ 30
DDX6P26196 PPP1R10-201ENST00000376511 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.45e-7■■■■■ 30
DDX6P26196 SKI-202ENST00000478223 294 ntTSL 312.42□□□□□ -0.425e-7■■■■■ 30
DDX6P26196 HCFC1-202ENST00000369984 8375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.435e-7■■■■■ 30
DDX6P26196 HSPH1-204ENST00000445273 4987 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.475e-7■■■■■ 30
DDX6P26196 KDM5B-203ENST00000367265 10345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.55e-7■■■■■ 30
DDX6P26196 KANSL1-229ENST00000639531 2731 ntTSL 511.75□□□□□ -0.535e-7■■■■■ 30
DDX6P26196 KANSL1-208ENST00000574590 5147 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.555e-7■■■■■ 30
DDX6P26196 KANSL1-215ENST00000576870 2848 ntTSL 211.57□□□□□ -0.565e-7■■■■■ 30
DDX6P26196 KANSL1-201ENST00000262419 5309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.575e-7■■■■■ 30
DDX6P26196 KANSL1-211ENST00000575318 4935 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.585e-7■■■■■ 30
DDX6P26196 BTG2-201ENST00000290551 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.593e-8■■■■■ 30
DDX6P26196 MYH9-201ENST00000216181 7501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.65e-7■■■■■ 30
DDX6P26196 HSPH1-209ENST00000630972 3570 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.785e-7■■■■■ 30
DDX6P26196 HUWE1-202ENST00000262854 14739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.795e-7■■■■■ 30
DDX6P26196 SMYD3-206ENST00000455277 566 ntTSL 59.64□□□□□ -0.875e-7■■■■■ 30
DDX6P26196 ZFP30-202ENST00000392144 3916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.875e-7■■■■■ 30
DDX6P26196 KANSL1-205ENST00000572904 4973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.965e-7■■■■■ 30
DDX6P26196 HUWE1-204ENST00000426907 4805 ntTSL 58.96□□□□□ -0.975e-7■■■■■ 30
DDX6P26196 KANSL1-204ENST00000572218 9095 ntTSL 1 (best)8.94□□□□□ -0.985e-7■■■■■ 30
DDX6P26196 ZFP30-204ENST00000514101 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.025e-7■■■■■ 30
DDX6P26196 KDM5B-210ENST00000602511 542 ntTSL 58.52□□□□□ -1.055e-7■■■■■ 30
DDX6P26196 CDC42-201ENST00000315554 1452 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.095e-7■■■■■ 30
DDX6P26196 CDC42-205ENST00000498236 816 ntTSL 57.81□□□□□ -1.165e-7■■■■■ 30
DDX6P26196 DDX6-207ENST00000617381 2883 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.232e-6■■■■■ 30
DDX6P26196 KANSL1-232ENST00000640092 1529 ntTSL 57.34□□□□□ -1.235e-7■■■■■ 30
DDX6P26196 HUWE1-203ENST00000342160 14796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.35e-7■■■■■ 30
DDX6P26196 DDX6-208ENST00000620157 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.357e-7■■■■■ 30
DDX6P26196 HUWE1-214ENST00000612484 14311 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.515e-7■■■■■ 30
DDX6P26196 ZFP30-209ENST00000589018 444 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.725e-7■■■■■ 30
DDX6P26196 KANSL1-212ENST00000576137 815 ntTSL 24.15□□□□□ -1.755e-7■■■■■ 30
DDX6P26196 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.962e-6■■■■■ 30
DDX6P26196 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC33.65■■■□□ 2.981e-18■■■■■ 30
DDX6P26196 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.31e-18■■■■■ 30
DDX6P26196 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.432e-6■■■■■ 30
DDX6P26196 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.432e-6■■■■■ 30
DDX6P26196 PLCG1-215ENST00000608689 969 ntTSL 515.28■□□□□ 0.042e-6■■■■■ 30
DDX6P26196 PLCG1-217ENST00000609257 956 ntTSL 513.81□□□□□ -0.22e-6■■■■■ 30
DDX6P26196 PLCG1-214ENST00000607954 1005 ntTSL 513.14□□□□□ -0.312e-6■■■■■ 30
DDX6P26196 PLCG1-219ENST00000612731 544 ntTSL 312.92□□□□□ -0.342e-6■■■■■ 30
DDX6P26196 PLCG1-216ENST00000608885 865 ntTSL 58.86□□□□□ -0.992e-6■■■■■ 30
DDX6P26196 PLCG1-213ENST00000599785 880 ntTSL 58.79□□□□□ -12e-6■■■■■ 30
DDX6P26196 PLCG1-218ENST00000609821 570 ntTSL 57.01□□□□□ -1.292e-6■■■■■ 30
DDX6P26196 PPP2CB-207ENST00000520500 603 ntTSL 46.61□□□□□ -1.351e-18■■■■■ 30
DDX6P26196 PPP2CB-202ENST00000518243 577 ntTSL 34.54□□□□□ -1.681e-18■■■■■ 30
DDX6P26196 RNF43-208ENST00000584437 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.371e-6■■■■■ 29.9
DDX6P26196 RNF43-201ENST00000407977 5516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.381e-6■■■■■ 29.9
DDX6P26196 RNF43-203ENST00000577716 4367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.731e-6■■■■■ 29.9
DDX6P26196 F7-203ENST00000444337 564 ntTSL 521.32■■□□□ 13e-7■■■■■ 29.9
DDX6P26196 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.213e-7■■■■■ 29.9
DDX6P26196 F7-206ENST00000541084 2873 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.683e-7■■■■■ 29.9
DDX6P26196 F7-202ENST00000375581 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.773e-7■■■■■ 29.9
DDX6P26196 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.421e-7■■■■■ 29.9
DDX6P26196 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.179e-10■■■■■ 29.9
DDX6P26196 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.143e-9■■■■■ 29.9
DDX6P26196 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.113e-9■■■■■ 29.9
DDX6P26196 SUN1-235ENST00000497943 2824 ntTSL 216.55■□□□□ 0.242e-11■■■■■ 29.8
DDX6P26196 SUN1-222ENST00000457861 2975 ntTSL 214.71□□□□□ -0.052e-11■■■■■ 29.8
DDX6P26196 SUN1-206ENST00000413171 4488 ntTSL 511.23□□□□□ -0.612e-11■■■■■ 29.8
DDX6P26196 SUN1-213ENST00000433212 3474 ntTSL 510.83□□□□□ -0.672e-11■■■■■ 29.8
DDX6P26196 SUN1-212ENST00000429178 3701 ntTSL 1 (best)9.98□□□□□ -0.812e-11■■■■■ 29.8
DDX6P26196 SUN1-202ENST00000389574 3812 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.862e-11■■■■■ 29.8
DDX6P26196 SUN1-210ENST00000425407 3868 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.922e-11■■■■■ 29.8
DDX6P26196 SUN1-219ENST00000452783 3717 ntTSL 2 BASIC9.11□□□□□ -0.952e-11■■■■■ 29.8
DDX6P26196 SUN1-205ENST00000405266 4062 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.962e-11■■■■■ 29.8
DDX6P26196 SUN1-203ENST00000401592 3953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.992e-11■■■■■ 29.8
DDX6P26196 SUN1-229ENST00000475971 4038 ntTSL 1 (best)8.83□□□□□ -12e-11■■■■■ 29.8
DDX6P26196 MAP2K1-202ENST00000425818 1338 ntTSL 523.65■■□□□ 1.386e-8■■■■■ 29.8
DDX6P26196 DSP-202ENST00000418664 7812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.492e-8■■■■■ 29.8
DDX6P26196 DSP-201ENST00000379802 9796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.772e-8■■■■■ 29.8
DDX6P26196 ZNF217-205ENST00000540425 568 ntTSL 37.57□□□□□ -1.22e-6■■■■■ 29.7
DDX6P26196 SH3D21-202ENST00000474766 2043 ntTSL 1 (best)20.39■□□□□ 0.861e-13■■■■■ 29.7
DDX6P26196 SH3D21-203ENST00000480549 3182 ntTSL 216.57■□□□□ 0.241e-13■■■■■ 29.7
DDX6P26196 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.132e-9■■■■■ 29.7
DDX6P26196 NOL4L-209ENST00000485364 885 ntTSL 1 (best)25.69■■□□□ 1.72e-6■■■■■ 29.7
DDX6P26196 NOL4L-201ENST00000201961 971 ntAPPRIS ALT2 TSL 325.32■■□□□ 1.642e-6■■■■■ 29.7
DDX6P26196 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.282e-6■■■■■ 29.7
DDX6P26196 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.375e-9■■■■■ 29.6
DDX6P26196 PCGF2-201ENST00000610747 459 ntTSL 214.25□□□□□ -0.133e-10■■■■■ 29.6
DDX6P26196 ZFPM1-202ENST00000562417 497 ntTSL 318.64■□□□□ 0.576e-7■■■■■ 29.6
DDX6P26196 TNS3-201ENST00000311160 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.77e-6■■■■■ 29.6
DDX6P26196 TNS3-204ENST00000428457 5070 ntTSL 1 (best)9.93□□□□□ -0.827e-6■■■■■ 29.6
DDX6P26196 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.35e-6■■■■■ 29.6
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