Protein–RNA interactions for Protein: P25786

PSMA1, Proteasome subunit alpha type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA1P25786 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMA1P25786 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMA1P25786 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMA1P25786 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMA1P25786 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMA1P25786 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMA1P25786 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMA1P25786 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMA1P25786 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMA1P25786 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMA1P25786 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMA1P25786 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMA1P25786 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSMA1P25786 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSMA1P25786 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSMA1P25786 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSMA1P25786 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSMA1P25786 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSMA1P25786 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSMA1P25786 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSMA1P25786 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PSMA1P25786 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PSMA1P25786 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PSMA1P25786 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSMA1P25786 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSMA1P25786 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PSMA1P25786 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSMA1P25786 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSMA1P25786 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PSMA1P25786 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PSMA1P25786 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSMA1P25786 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSMA1P25786 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSMA1P25786 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSMA1P25786 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSMA1P25786 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSMA1P25786 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSMA1P25786 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSMA1P25786 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSMA1P25786 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSMA1P25786 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSMA1P25786 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSMA1P25786 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSMA1P25786 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSMA1P25786 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSMA1P25786 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSMA1P25786 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSMA1P25786 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSMA1P25786 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSMA1P25786 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSMA1P25786 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSMA1P25786 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSMA1P25786 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSMA1P25786 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSMA1P25786 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSMA1P25786 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSMA1P25786 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSMA1P25786 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSMA1P25786 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSMA1P25786 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSMA1P25786 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSMA1P25786 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSMA1P25786 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSMA1P25786 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSMA1P25786 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSMA1P25786 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSMA1P25786 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSMA1P25786 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSMA1P25786 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSMA1P25786 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSMA1P25786 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSMA1P25786 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSMA1P25786 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSMA1P25786 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSMA1P25786 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSMA1P25786 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSMA1P25786 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSMA1P25786 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMA1P25786 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMA1P25786 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMA1P25786 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMA1P25786 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMA1P25786 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMA1P25786 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMA1P25786 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMA1P25786 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMA1P25786 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMA1P25786 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMA1P25786 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMA1P25786 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSMA1P25786 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PSMA1P25786 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSMA1P25786 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSMA1P25786 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSMA1P25786 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSMA1P25786 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSMA1P25786 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PSMA1P25786 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PSMA1P25786 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
PSMA1P25786 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms