Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VAMP1P23763 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
VAMP1P23763 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VAMP1P23763 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
VAMP1P23763 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
VAMP1P23763 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
VAMP1P23763 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
VAMP1P23763 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
VAMP1P23763 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
VAMP1P23763 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
VAMP1P23763 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
VAMP1P23763 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
VAMP1P23763 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
VAMP1P23763 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
VAMP1P23763 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
VAMP1P23763 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
VAMP1P23763 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
VAMP1P23763 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VAMP1P23763 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VAMP1P23763 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VAMP1P23763 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VAMP1P23763 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VAMP1P23763 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VAMP1P23763 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
VAMP1P23763 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
VAMP1P23763 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
VAMP1P23763 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
VAMP1P23763 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
VAMP1P23763 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
VAMP1P23763 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VAMP1P23763 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VAMP1P23763 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VAMP1P23763 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
VAMP1P23763 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VAMP1P23763 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
VAMP1P23763 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VAMP1P23763 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
VAMP1P23763 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
VAMP1P23763 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VAMP1P23763 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
VAMP1P23763 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
VAMP1P23763 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
VAMP1P23763 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VAMP1P23763 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
VAMP1P23763 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
VAMP1P23763 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VAMP1P23763 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VAMP1P23763 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
VAMP1P23763 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VAMP1P23763 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
VAMP1P23763 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VAMP1P23763 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VAMP1P23763 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VAMP1P23763 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VAMP1P23763 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VAMP1P23763 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VAMP1P23763 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VAMP1P23763 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VAMP1P23763 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VAMP1P23763 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VAMP1P23763 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VAMP1P23763 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VAMP1P23763 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VAMP1P23763 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VAMP1P23763 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VAMP1P23763 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VAMP1P23763 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VAMP1P23763 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VAMP1P23763 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VAMP1P23763 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VAMP1P23763 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VAMP1P23763 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VAMP1P23763 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VAMP1P23763 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
VAMP1P23763 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
VAMP1P23763 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VAMP1P23763 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
VAMP1P23763 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
VAMP1P23763 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
VAMP1P23763 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
VAMP1P23763 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
VAMP1P23763 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
VAMP1P23763 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
VAMP1P23763 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
VAMP1P23763 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
VAMP1P23763 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.61
VAMP1P23763 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
VAMP1P23763 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
VAMP1P23763 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
VAMP1P23763 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
VAMP1P23763 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
VAMP1P23763 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
VAMP1P23763 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
VAMP1P23763 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
VAMP1P23763 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
VAMP1P23763 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
VAMP1P23763 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
VAMP1P23763 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
VAMP1P23763 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
VAMP1P23763 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms