Protein–RNA interactions for Protein: P21709

EPHA1, Ephrin type-A receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA1P21709 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EPHA1P21709 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EPHA1P21709 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
EPHA1P21709 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EPHA1P21709 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EPHA1P21709 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EPHA1P21709 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EPHA1P21709 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EPHA1P21709 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
EPHA1P21709 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
EPHA1P21709 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EPHA1P21709 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
EPHA1P21709 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EPHA1P21709 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
EPHA1P21709 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
EPHA1P21709 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
EPHA1P21709 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
EPHA1P21709 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
EPHA1P21709 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
EPHA1P21709 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
EPHA1P21709 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EPHA1P21709 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EPHA1P21709 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
EPHA1P21709 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EPHA1P21709 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EPHA1P21709 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EPHA1P21709 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EPHA1P21709 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EPHA1P21709 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EPHA1P21709 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EPHA1P21709 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
EPHA1P21709 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EPHA1P21709 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
EPHA1P21709 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
EPHA1P21709 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EPHA1P21709 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
EPHA1P21709 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EPHA1P21709 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
EPHA1P21709 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
EPHA1P21709 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EPHA1P21709 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EPHA1P21709 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EPHA1P21709 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EPHA1P21709 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
EPHA1P21709 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
EPHA1P21709 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EPHA1P21709 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EPHA1P21709 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EPHA1P21709 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EPHA1P21709 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EPHA1P21709 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EPHA1P21709 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EPHA1P21709 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EPHA1P21709 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EPHA1P21709 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EPHA1P21709 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EPHA1P21709 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EPHA1P21709 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EPHA1P21709 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
EPHA1P21709 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EPHA1P21709 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EPHA1P21709 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EPHA1P21709 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EPHA1P21709 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EPHA1P21709 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EPHA1P21709 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EPHA1P21709 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EPHA1P21709 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EPHA1P21709 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EPHA1P21709 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EPHA1P21709 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EPHA1P21709 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EPHA1P21709 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EPHA1P21709 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EPHA1P21709 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
EPHA1P21709 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EPHA1P21709 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EPHA1P21709 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EPHA1P21709 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EPHA1P21709 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EPHA1P21709 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EPHA1P21709 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
EPHA1P21709 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EPHA1P21709 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EPHA1P21709 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EPHA1P21709 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EPHA1P21709 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EPHA1P21709 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
EPHA1P21709 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EPHA1P21709 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
EPHA1P21709 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
EPHA1P21709 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
EPHA1P21709 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
EPHA1P21709 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
EPHA1P21709 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
EPHA1P21709 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
EPHA1P21709 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
EPHA1P21709 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EPHA1P21709 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EPHA1P21709 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms