Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYT1P21579 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SYT1P21579 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SYT1P21579 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SYT1P21579 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SYT1P21579 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SYT1P21579 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SYT1P21579 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SYT1P21579 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SYT1P21579 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SYT1P21579 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SYT1P21579 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SYT1P21579 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYT1P21579 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYT1P21579 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYT1P21579 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYT1P21579 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYT1P21579 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYT1P21579 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SYT1P21579 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYT1P21579 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SYT1P21579 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SYT1P21579 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SYT1P21579 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SYT1P21579 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SYT1P21579 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SYT1P21579 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SYT1P21579 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SYT1P21579 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SYT1P21579 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYT1P21579 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYT1P21579 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYT1P21579 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYT1P21579 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYT1P21579 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYT1P21579 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYT1P21579 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYT1P21579 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYT1P21579 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYT1P21579 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYT1P21579 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYT1P21579 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SYT1P21579 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SYT1P21579 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SYT1P21579 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SYT1P21579 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SYT1P21579 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SYT1P21579 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SYT1P21579 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SYT1P21579 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SYT1P21579 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SYT1P21579 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SYT1P21579 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SYT1P21579 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SYT1P21579 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SYT1P21579 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SYT1P21579 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SYT1P21579 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SYT1P21579 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SYT1P21579 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SYT1P21579 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SYT1P21579 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SYT1P21579 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SYT1P21579 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SYT1P21579 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
SYT1P21579 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SYT1P21579 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SYT1P21579 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SYT1P21579 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SYT1P21579 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SYT1P21579 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SYT1P21579 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SYT1P21579 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SYT1P21579 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SYT1P21579 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SYT1P21579 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SYT1P21579 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SYT1P21579 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SYT1P21579 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SYT1P21579 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SYT1P21579 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SYT1P21579 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SYT1P21579 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SYT1P21579 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SYT1P21579 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SYT1P21579 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SYT1P21579 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SYT1P21579 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SYT1P21579 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SYT1P21579 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SYT1P21579 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYT1P21579 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYT1P21579 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SYT1P21579 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYT1P21579 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYT1P21579 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYT1P21579 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYT1P21579 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYT1P21579 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYT1P21579 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms