Protein–RNA interactions for Protein: P19484

TFEB, Transcription factor EB, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFEBP19484 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TFEBP19484 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TFEBP19484 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TFEBP19484 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TFEBP19484 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TFEBP19484 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TFEBP19484 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TFEBP19484 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TFEBP19484 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TFEBP19484 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TFEBP19484 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TFEBP19484 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TFEBP19484 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TFEBP19484 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TFEBP19484 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TFEBP19484 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TFEBP19484 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TFEBP19484 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TFEBP19484 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TFEBP19484 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TFEBP19484 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TFEBP19484 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TFEBP19484 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TFEBP19484 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TFEBP19484 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TFEBP19484 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TFEBP19484 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TFEBP19484 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TFEBP19484 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TFEBP19484 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TFEBP19484 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TFEBP19484 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TFEBP19484 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TFEBP19484 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TFEBP19484 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TFEBP19484 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TFEBP19484 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TFEBP19484 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TFEBP19484 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TFEBP19484 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TFEBP19484 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TFEBP19484 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TFEBP19484 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TFEBP19484 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TFEBP19484 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TFEBP19484 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TFEBP19484 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TFEBP19484 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TFEBP19484 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TFEBP19484 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TFEBP19484 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TFEBP19484 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TFEBP19484 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TFEBP19484 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TFEBP19484 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TFEBP19484 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TFEBP19484 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TFEBP19484 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TFEBP19484 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TFEBP19484 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TFEBP19484 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TFEBP19484 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TFEBP19484 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TFEBP19484 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TFEBP19484 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TFEBP19484 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TFEBP19484 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TFEBP19484 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TFEBP19484 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TFEBP19484 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TFEBP19484 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TFEBP19484 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TFEBP19484 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TFEBP19484 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TFEBP19484 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TFEBP19484 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TFEBP19484 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TFEBP19484 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TFEBP19484 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TFEBP19484 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TFEBP19484 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TFEBP19484 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TFEBP19484 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TFEBP19484 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TFEBP19484 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TFEBP19484 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TFEBP19484 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TFEBP19484 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TFEBP19484 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TFEBP19484 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TFEBP19484 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TFEBP19484 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TFEBP19484 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TFEBP19484 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TFEBP19484 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TFEBP19484 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TFEBP19484 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TFEBP19484 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TFEBP19484 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TFEBP19484 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms