Protein–RNA interactions for Protein: P17540

CKMT2, Creatine kinase S-type, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKMT2P17540 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CKMT2P17540 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CKMT2P17540 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CKMT2P17540 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CKMT2P17540 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CKMT2P17540 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CKMT2P17540 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CKMT2P17540 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CKMT2P17540 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CKMT2P17540 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CKMT2P17540 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CKMT2P17540 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CKMT2P17540 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CKMT2P17540 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CKMT2P17540 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CKMT2P17540 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CKMT2P17540 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CKMT2P17540 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CKMT2P17540 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CKMT2P17540 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CKMT2P17540 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CKMT2P17540 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CKMT2P17540 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CKMT2P17540 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CKMT2P17540 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CKMT2P17540 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CKMT2P17540 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CKMT2P17540 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CKMT2P17540 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CKMT2P17540 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CKMT2P17540 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CKMT2P17540 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CKMT2P17540 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CKMT2P17540 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CKMT2P17540 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CKMT2P17540 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CKMT2P17540 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CKMT2P17540 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CKMT2P17540 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CKMT2P17540 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CKMT2P17540 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CKMT2P17540 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CKMT2P17540 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CKMT2P17540 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CKMT2P17540 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CKMT2P17540 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CKMT2P17540 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CKMT2P17540 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CKMT2P17540 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CKMT2P17540 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CKMT2P17540 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CKMT2P17540 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CKMT2P17540 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CKMT2P17540 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CKMT2P17540 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CKMT2P17540 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CKMT2P17540 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CKMT2P17540 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CKMT2P17540 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CKMT2P17540 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CKMT2P17540 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CKMT2P17540 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CKMT2P17540 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CKMT2P17540 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CKMT2P17540 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CKMT2P17540 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CKMT2P17540 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CKMT2P17540 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CKMT2P17540 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CKMT2P17540 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CKMT2P17540 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CKMT2P17540 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CKMT2P17540 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CKMT2P17540 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CKMT2P17540 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CKMT2P17540 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CKMT2P17540 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CKMT2P17540 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CKMT2P17540 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CKMT2P17540 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CKMT2P17540 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CKMT2P17540 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CKMT2P17540 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CKMT2P17540 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CKMT2P17540 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CKMT2P17540 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CKMT2P17540 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CKMT2P17540 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CKMT2P17540 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CKMT2P17540 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CKMT2P17540 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CKMT2P17540 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CKMT2P17540 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CKMT2P17540 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CKMT2P17540 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CKMT2P17540 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CKMT2P17540 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CKMT2P17540 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CKMT2P17540 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CKMT2P17540 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms