Protein–RNA interactions for Protein: P16520

GNB3, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB3P16520 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GNB3P16520 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GNB3P16520 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GNB3P16520 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GNB3P16520 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GNB3P16520 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GNB3P16520 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GNB3P16520 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GNB3P16520 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
GNB3P16520 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GNB3P16520 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GNB3P16520 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GNB3P16520 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GNB3P16520 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GNB3P16520 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GNB3P16520 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GNB3P16520 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GNB3P16520 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GNB3P16520 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GNB3P16520 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GNB3P16520 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GNB3P16520 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GNB3P16520 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GNB3P16520 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GNB3P16520 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
GNB3P16520 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GNB3P16520 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GNB3P16520 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GNB3P16520 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GNB3P16520 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GNB3P16520 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GNB3P16520 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GNB3P16520 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GNB3P16520 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GNB3P16520 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GNB3P16520 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GNB3P16520 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GNB3P16520 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GNB3P16520 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GNB3P16520 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GNB3P16520 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GNB3P16520 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GNB3P16520 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GNB3P16520 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GNB3P16520 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GNB3P16520 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
GNB3P16520 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GNB3P16520 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GNB3P16520 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GNB3P16520 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GNB3P16520 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GNB3P16520 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GNB3P16520 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GNB3P16520 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GNB3P16520 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GNB3P16520 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GNB3P16520 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GNB3P16520 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
GNB3P16520 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
GNB3P16520 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
GNB3P16520 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GNB3P16520 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
GNB3P16520 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GNB3P16520 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
GNB3P16520 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GNB3P16520 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
GNB3P16520 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GNB3P16520 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GNB3P16520 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GNB3P16520 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GNB3P16520 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GNB3P16520 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GNB3P16520 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GNB3P16520 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GNB3P16520 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GNB3P16520 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GNB3P16520 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GNB3P16520 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GNB3P16520 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GNB3P16520 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GNB3P16520 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GNB3P16520 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GNB3P16520 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GNB3P16520 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GNB3P16520 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GNB3P16520 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GNB3P16520 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GNB3P16520 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GNB3P16520 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GNB3P16520 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GNB3P16520 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GNB3P16520 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GNB3P16520 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GNB3P16520 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GNB3P16520 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GNB3P16520 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GNB3P16520 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GNB3P16520 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GNB3P16520 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GNB3P16520 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms