Protein–RNA interactions for Protein: P13994

CCDC130, Coiled-coil domain-containing protein 130, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC130P13994 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC130P13994 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC130P13994 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC130P13994 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC130P13994 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC130P13994 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC130P13994 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC130P13994 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC130P13994 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC130P13994 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC130P13994 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC130P13994 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC130P13994 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC130P13994 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC130P13994 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC130P13994 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC130P13994 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC130P13994 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC130P13994 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC130P13994 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC130P13994 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC130P13994 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC130P13994 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC130P13994 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC130P13994 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC130P13994 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC130P13994 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC130P13994 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC130P13994 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC130P13994 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC130P13994 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC130P13994 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC130P13994 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC130P13994 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC130P13994 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC130P13994 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC130P13994 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC130P13994 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC130P13994 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC130P13994 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC130P13994 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC130P13994 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CCDC130P13994 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CCDC130P13994 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC130P13994 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC130P13994 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC130P13994 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC130P13994 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC130P13994 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC130P13994 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC130P13994 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC130P13994 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC130P13994 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC130P13994 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC130P13994 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC130P13994 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC130P13994 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC130P13994 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC130P13994 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC130P13994 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC130P13994 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC130P13994 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC130P13994 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC130P13994 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC130P13994 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC130P13994 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC130P13994 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC130P13994 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC130P13994 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC130P13994 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC130P13994 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC130P13994 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC130P13994 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC130P13994 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC130P13994 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC130P13994 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC130P13994 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC130P13994 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC130P13994 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC130P13994 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC130P13994 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC130P13994 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC130P13994 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC130P13994 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC130P13994 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC130P13994 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC130P13994 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC130P13994 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC130P13994 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC130P13994 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC130P13994 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC130P13994 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC130P13994 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC130P13994 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC130P13994 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC130P13994 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC130P13994 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC130P13994 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC130P13994 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC130P13994 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms