Protein–RNA interactions for Protein: P13569

CFTR, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, humanhuman

Predictions only

Length 1,480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFTRP13569 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
CFTRP13569 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC39.33■■■■□ 3.89
CFTRP13569 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
CFTRP13569 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC39.33■■■■□ 3.89
CFTRP13569 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
CFTRP13569 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC39.33■■■■□ 3.89
CFTRP13569 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
CFTRP13569 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.33■■■■□ 3.89
CFTRP13569 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.89
CFTRP13569 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.89
CFTRP13569 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC39.32■■■■□ 3.89
CFTRP13569 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC39.32■■■■□ 3.89
CFTRP13569 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.89
CFTRP13569 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.89
CFTRP13569 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.88
CFTRP13569 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC39.32■■■■□ 3.88
CFTRP13569 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.32■■■■□ 3.88
CFTRP13569 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
CFTRP13569 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.31■■■■□ 3.88
CFTRP13569 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC39.31■■■■□ 3.88
CFTRP13569 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC39.31■■■■□ 3.88
CFTRP13569 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
CFTRP13569 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC39.31■■■■□ 3.88
CFTRP13569 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
CFTRP13569 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC39.31■■■■□ 3.88
CFTRP13569 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC39.3■■■■□ 3.88
CFTRP13569 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
CFTRP13569 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
CFTRP13569 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.3■■■■□ 3.88
CFTRP13569 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
CFTRP13569 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
CFTRP13569 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
CFTRP13569 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.29■■■■□ 3.88
CFTRP13569 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
CFTRP13569 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC39.29■■■■□ 3.88
CFTRP13569 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
CFTRP13569 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC39.29■■■■□ 3.88
CFTRP13569 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
CFTRP13569 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
CFTRP13569 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
CFTRP13569 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
CFTRP13569 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC39.28■■■■□ 3.88
CFTRP13569 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC39.28■■■■□ 3.88
CFTRP13569 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC39.28■■■■□ 3.88
CFTRP13569 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC39.28■■■■□ 3.88
CFTRP13569 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
CFTRP13569 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.28■■■■□ 3.88
CFTRP13569 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
CFTRP13569 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC39.27■■■■□ 3.88
CFTRP13569 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC39.27■■■■□ 3.88
CFTRP13569 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC39.27■■■■□ 3.88
CFTRP13569 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
CFTRP13569 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
CFTRP13569 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC39.26■■■■□ 3.88
CFTRP13569 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
CFTRP13569 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.26■■■■□ 3.88
CFTRP13569 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.87
CFTRP13569 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC39.25■■■■□ 3.87
CFTRP13569 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
CFTRP13569 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
CFTRP13569 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC39.25■■■■□ 3.87
CFTRP13569 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
CFTRP13569 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
CFTRP13569 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC39.25■■■■□ 3.87
CFTRP13569 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
CFTRP13569 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.24■■■■□ 3.87
CFTRP13569 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC39.24■■■■□ 3.87
CFTRP13569 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
CFTRP13569 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC39.24■■■■□ 3.87
CFTRP13569 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
CFTRP13569 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
CFTRP13569 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
CFTRP13569 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC39.24■■■■□ 3.87
CFTRP13569 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC39.24■■■■□ 3.87
CFTRP13569 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC39.24■■■■□ 3.87
CFTRP13569 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC39.23■■■■□ 3.87
CFTRP13569 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC39.23■■■■□ 3.87
CFTRP13569 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
CFTRP13569 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
CFTRP13569 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
CFTRP13569 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
CFTRP13569 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC39.22■■■■□ 3.87
CFTRP13569 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
CFTRP13569 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC39.22■■■■□ 3.87
CFTRP13569 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
CFTRP13569 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC39.21■■■■□ 3.87
CFTRP13569 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC39.21■■■■□ 3.87
CFTRP13569 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
CFTRP13569 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
CFTRP13569 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
CFTRP13569 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
CFTRP13569 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
CFTRP13569 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC39.2■■■■□ 3.87
CFTRP13569 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.2■■■■□ 3.87
CFTRP13569 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
CFTRP13569 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.2■■■■□ 3.87
CFTRP13569 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC39.2■■■■□ 3.87
CFTRP13569 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC39.19■■■■□ 3.86
CFTRP13569 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC39.19■■■■□ 3.86
CFTRP13569 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC39.19■■■■□ 3.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms